配列名:pMandshurica_CH264_4_v1.0
ゲノム配列名 | pMandshurica_CH264_4_v1.0 | 系統名 | Chinese accessions CH264.4 |
配列数 | 8 | 染色体数 | NA |
配列長 (bp) | 223,661,229 | N50長 (bp) | 29,447,199 |
遺伝子の数 | 41,386 | 遺伝子数由来ファイル | Prunus_Mandshurica_peptide.fasta.gz |
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 | 0 | Hayai-Annotation バージョン | zen_v2.0 |
シーケンシングの方法 | Oxford Nanopore | 取得した配列量 | 139x |
アセンブリ方法 | SMARTdenovo (git commit 5cc1356), Ra (git commit d388a2f) | 推定ゲノムサイズ (Mb) | 231.77_ |
シーケンシングの方法のコメント | NA | コメント | NA |
論文クレジット情報 | 準備中 | データ/DB クレジット情報 | 準備中 |
責任著者 | V_ronique Decroocq (University of Bordeaux) | データソース名 | GDR: Genome Database For Rosaceae |
論文 (DOIコード) | 10.1038/s41467-021-24283-6 | データソースURL | https://www.rosaceae.org/ |
BUSCO バージョン | BUSCO データセット | ||
BUSCO ゲノム | BUSCO 遺伝子 (pep/cds) |