配列名:Srexii.v1.0
ゲノム配列名 | Srexii.v1.0 | 系統名 | KJong-Faraway [RBGE20180766-19870333] |
配列数 | 5,855 | 染色体数 | 2n = 2x = 32 |
配列長 (bp) | 766,640,919 | N50長 (bp) | 3,713,391 |
遺伝子の数 | 44,947 | 遺伝子数由来ファイル | PG_Sr_cds_nuc.fa |
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 | 0 | Hayai-Annotation バージョン | zen_v2.0 |
シーケンシングの方法 | Oxford Nanopore Technologies, PromethION | 取得した配列量 | 170x |
アセンブリ方法 | Canu v.1.8, Racon v.1.4.11, Medaka v.0.11.5 | 推定ゲノムサイズ (Mb) | 929 |
シーケンシングの方法のコメント | NA | コメント | Reference of estimated genome size (Moeller, 2018 South African Journal of Botany 114:323-344) |
論文クレジット情報 | 準備中 | データ/DB クレジット情報 | 準備中 |
責任著者 | Kanae Nishii (Kanagawa University / Royal Botanic Garden Edinburgh) | データソース名 | Plant GARDEN |
論文 (DOIコード) | 10.1002/pld3.388 | データソースURL | https://plantgarden.jp/ |
BUSCO バージョン | 4.0.2 | BUSCO データセット | viridiplantae_obo10 |
BUSCO ゲノム | C:99.0%[S:82.1%,D:16.9%],F:0.7%,M:0.3%,n:425 | BUSCO 遺伝子 (pep/cds) | C:89.6%[S:77.4%,D:12.2%],F:8.9%,M:1.5%,n:425 |