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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Rhododendron simsii , Potted azalea , タイワンヤマツツジ

Rhododendron simsii

Genome Assembly ID:t118357.G001

配列名:ASM1428224v1

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 ASM1428224v1 系統名 NA
配列数 552 染色体数 NA
配列長 (bp) 528,637,147 N50長 (bp) 36,350,743
遺伝子の数 32,999 遺伝子数由来ファイル GCA_014282245.1_ASM1428224v1_protein.faa
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 0 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 PacBio Sequel 取得した配列量 100.0x
アセンブリ方法 SMARTdenovo v.1.0.0, WTDBG v.2.1, Canu V.1.7, FALCON-Phase v.0.1.0-beta 推定ゲノムサイズ (Mb) 525
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Yves Van de Peer(Ghent University, University of Pretoria, Nanjing Agricultural University), Jian-Feng Mao(Forestry University) データソース名 NCBI
論文 (DOIコード) 10.1038/s41467-020-18771-4 データソースURL https://www.ncbi.nlm.nih.gov/
BUSCO バージョン 5.1.0 BUSCO データセット embryophyta_odb10
BUSCO ゲノム C:97.7%[S:91.1%,D:6.6%],F:0.9%,M:1.4%,n:1614 BUSCO 遺伝子 (pep/cds) C:90.3%[S:83.2%,D:7.1%],F:3.3%,M:6.4%,n:1614

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染色体 /
Scaffolds
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fasta
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