配列名:Amacr_genome
ゲノム配列名 | Amacr_genome | 系統名 | Arusha |
配列数 | 625 | 染色体数 | n = 17 |
配列長 (bp) | 370,913,848 | N50長 (bp) | 21,701,286 |
遺伝子の数 | 25,477 | 遺伝子数由来ファイル | Amacr_pep_20210312.fasta.gz |
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 | 0 | Hayai-Annotation バージョン | zen_v2.0 |
シーケンシングの方法 | Illumina, Oxford Nanopore, Hi-C | 取得した配列量 | 24.5 Gb(Oxford Nanopore), 110 Gb(Illumina),120 Gb(Hi-C) |
アセンブリ方法 | WTDBG2 | 推定ゲノムサイズ (Mb) | 399 |
シーケンシングの方法のコメント | NA | コメント | NA |
論文クレジット情報 | 準備中 | データ/DB クレジット情報 | 準備中 |
責任著者 | Katherine J. Denby (University of York) | データソース名 | the AOCC portal of ORCAE |
論文 (DOIコード) | 10.1111/tpj.15298 | データソースURL | https://bioinformatics.psb.ugent.be/orcae/overview/Amacr |
BUSCO バージョン | BUSCO データセット | ||
BUSCO ゲノム | BUSCO 遺伝子 (pep/cds) |