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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Amaranthus cruentus , Grain and leaf amaranth , スギモリゲイトウ

Amaranthus cruentus

Genome Assembly ID:t117272.G001

配列名:Amacr_genome

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 Amacr_genome 系統名 Arusha
配列数 625 染色体数 n = 17
配列長 (bp) 370,913,848 N50長 (bp) 21,701,286
遺伝子の数 25,477 遺伝子数由来ファイル Amacr_pep_20210312.fasta.gz
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 0 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 Illumina, Oxford Nanopore, Hi-C 取得した配列量 24.5 Gb(Oxford Nanopore), 110 Gb(Illumina),120 Gb(Hi-C)
アセンブリ方法 WTDBG2 推定ゲノムサイズ (Mb) 399
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Katherine J. Denby (University of York) データソース名 the AOCC portal of ORCAE
論文 (DOIコード) 10.1111/tpj.15298 データソースURL https://bioinformatics.psb.ugent.be/orcae/overview/Amacr
BUSCO バージョン BUSCO データセット
BUSCO ゲノム BUSCO 遺伝子 (pep/cds)

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染色体 /
Scaffolds
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