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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Cyclocarya paliurus , Wheel wingnut, Qing qian liu , セイセンリュウ

Cyclocarya paliurus

Genome Assembly ID:t117167.G004

配列名:GWHBKKY00000000

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 GWHBKKY00000000 系統名 PA-tetra (protandrous tetraploid)
配列数 8,282 染色体数 2n = 4x = 64
配列長 (bp) 2,384,414,592 N50長 (bp) 34,524,742
遺伝子の数 83,936 遺伝子数由来ファイル GWHBKKY00000000.Protein.faa.gz
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 0 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 PacBio Sequel, Hi-C 取得した配列量 221x
アセンブリ方法 Canu v.1.7, 3D-DNA v.201008, ALLHiC 推定ゲノムサイズ (Mb) 2460 (1C = 1230 Mb)
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Shengzuo Fang (Nanjing Forestry University) データソース名 Genome Warehouse
論文 (DOIコード) 10.1016/j.gpb.2023.02.001 データソースURL https://bigd.big.ac.cn/gwh/
BUSCO バージョン BUSCO データセット
BUSCO ゲノム BUSCO 遺伝子 (pep/cds)

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染色体 /
Scaffolds
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fasta
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