Plant GARDEN 使い方 ▶︎

JA

EN

アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Cyclocarya paliurus , Wheel wingnut, Qing qian liu , セイセンリュウ

Cyclocarya paliurus

Genome Assembly ID:t117167.G002

配列名:GWHBKKX00000000

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 GWHBKKX00000000 系統名 PA-dip (protandrous)
配列数 1,688 染色体数 2n = 2x = 32
配列長 (bp) 586,790,002 N50長 (bp) 33,838,055
遺伝子の数 32,241 遺伝子数由来ファイル GWHBKKX00000000.Protein.faa.gz
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 0 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 PacBio Sequel, Hi-C 取得した配列量 223x
アセンブリ方法 Canu v.1.7, 3D-DNA v.201008, ALLHiC 推定ゲノムサイズ (Mb) 606 (1C)
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Shengzuo Fang (Nanjing Forestry University) データソース名 Genome Warehouse
論文 (DOIコード) 10.1016/j.gpb.2023.02.001 データソースURL https://bigd.big.ac.cn/gwh/
BUSCO バージョン BUSCO データセット
BUSCO ゲノム BUSCO 遺伝子 (pep/cds)

遺伝子をさがす

遺伝子データは登録されていません。

ゲノム配列を切り出す

染色体 /
Scaffolds
開始位置
終了位置
相補鎖を出力する
fasta
フォーマット