配列名:Othomaeum_386_v1.0
ゲノム配列名 | Othomaeum_386_v1.0 | 系統名 | NA |
配列数 | 625 | 染色体数 | 2n = 2x = 18 |
配列長 (bp) | 243,174,629 | N50長 (bp) | 2,386,382 |
遺伝子の数 | 28,437 | 遺伝子数由来ファイル | Othomaeum_386_v1.0.protein_primaryTranscriptOnly.fa |
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 | 0 | Hayai-Annotation バージョン | zen_v2.0 |
シーケンシングの方法 | PacBio RS II | 取得した配列量 | 72x |
アセンブリ方法 | Celera | 推定ゲノムサイズ (Mb) | 250 |
シーケンシングの方法のコメント | NA | コメント | NA |
論文クレジット情報 | 準備中 | データ/DB クレジット情報 | 準備中 |
責任著者 | Robert Van Buren (Daniel Danforth Plant Science Center) | データソース名 | Phytozome |
論文 (DOIコード) | 10.1038/nature15714 | データソースURL | https://phytozome-next.jgi.doe.gov/info/Othomaeum_v1_0 |
BUSCO バージョン | 5.1.0 | BUSCO データセット | embryophyta_odb10 |
BUSCO ゲノム | C:98.0%[S:94.0%,D:4.0%],F:0.7%,M:1.3%,n:1614 | BUSCO 遺伝子 (pep/cds) | C:71.6%[S:69.3%,D:2.3%],F:13.9%,M:14.5%,n:1614 |