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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Lycium chinense , Chinese boxthorn, Chinese wolfberry, Gou qi, Kuko , クコ

Lycium chinense

Genome Assembly ID:t112883.G001

配列名:Lycium_chinense_genome_chromosomes

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 Lycium_chinense_genome_chromosomes 系統名 voucher Liujq202005
配列数 12 染色体数 2n = 24
配列長 (bp) 1,408 N50長 (bp) 132,783,878
遺伝子の数 52,296 遺伝子数由来ファイル Lycium_chinense_genome_chromosomes.pep.fa.gz
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 52,296 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 PacBio Sequel II, Hi-C 取得した配列量 35.6x
アセンブリ方法 hifiasm v0.12, Bowtie 2 v2.3.0, LACHESIS v1.0 推定ゲノムサイズ (Mb) 1,516,475,906
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Jianquan Liu (Lanzhou University) データソース名 Figshare
論文 (DOIコード) 10.1038/s41467-023-44246-3 データソースURL https://figshare.com
BUSCO バージョン BUSCO データセット
BUSCO ゲノム BUSCO 遺伝子 (pep/cds)

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染色体 /
Scaffolds
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fasta
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