配列名:Lycium_chinense_genome_chromosomes
ゲノム配列名 | Lycium_chinense_genome_chromosomes | 系統名 | voucher Liujq202005 |
配列数 | 12 | 染色体数 | 2n = 24 |
配列長 (bp) | 1,408 | N50長 (bp) | 132,783,878 |
遺伝子の数 | 52,296 | 遺伝子数由来ファイル | Lycium_chinense_genome_chromosomes.pep.fa.gz |
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 | 52,296 | Hayai-Annotation バージョン | zen_v2.0 |
シーケンシングの方法 | PacBio Sequel II, Hi-C | 取得した配列量 | 35.6x |
アセンブリ方法 | hifiasm v0.12, Bowtie 2 v2.3.0, LACHESIS v1.0 | 推定ゲノムサイズ (Mb) | 1,516,475,906 |
シーケンシングの方法のコメント | NA | コメント | NA |
論文クレジット情報 | 準備中 | データ/DB クレジット情報 | 準備中 |
責任著者 | Jianquan Liu (Lanzhou University) | データソース名 | Figshare |
論文 (DOIコード) | 10.1038/s41467-023-44246-3 | データソースURL | https://figshare.com |
BUSCO バージョン | BUSCO データセット | ||
BUSCO ゲノム | BUSCO 遺伝子 (pep/cds) |