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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Chrysanthemum seticuspe , Wild chrysanthemum (seticuspe) , キクタニギク

Chrysanthemum seticuspe

Genome Assembly ID:t1111766.G002

配列名:Gojo-0 v1

ゲノム配列の詳細

配列名 Gojo-0 v1 系統名 Gojo-0
配列数 8,493 染色体数 2n = 2x = 18
配列長 (bp) 3,045,060,000 N50長 (bp) 347,131,000
遺伝子の数 74,259 遺伝子数由来ファイル CsGojo-0_v1_HC.pep
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 74,259 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 PacBio, Hi-C 取得した配列量 107x
アセンブリ方法 Platanus-allee v2.2.2, Flye, HiRise 推定ゲノムサイズ (Mb) 3,150
シーケンシングの方法のコメント コメント
論文 (DOIコード) 責任著者 Mmakoto Kusaba (Hiroshima University)
データソース名 Plant GARDEN データソースURL https://plantgarden.jp/
BUSCO バージョン 5.1.0 BUSCO データセット embryophyta_odb10
BUSCO ゲノム C:98.6%[S:91.5%,D:7.1%],F:0.7%,M:0.7%,n:1614 BUSCO 遺伝子 (pep/cds) C:93.6%[S:86.4%,D:7.2%],F:2.1%,M:4.3%,n:1614

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染色体 /
Scaffolds
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終了位置
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fasta
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