配列名:Gojo-0 v1
ゲノム配列名 | Gojo-0 v1 | 系統名 | Gojo-0 |
配列数 | 8,493 | 染色体数 | 2n = 2x = 18 |
配列長 (bp) | 3,045,060,000 | N50長 (bp) | 347,131,000 |
遺伝子の数 | 74,259 | 遺伝子数由来ファイル | CsGojo-0_v1_HC.pep |
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 | 74,259 | Hayai-Annotation バージョン | zen_v2.0 |
シーケンシングの方法 | PacBio, Hi-C | 取得した配列量 | 107x |
アセンブリ方法 | Platanus-allee v2.2.2, Flye, HiRise | 推定ゲノムサイズ (Mb) | 3,150 |
シーケンシングの方法のコメント | NA | コメント | NA |
論文クレジット情報 | 準備中 | データ/DB クレジット情報 | 準備中 |
責任著者 | Makoto Kusaba (Hiroshima University) | データソース名 | Plant GARDEN |
論文 (DOIコード) | データソースURL | https://plantgarden.jp/ | |
BUSCO バージョン | 5.1.0 | BUSCO データセット | embryophyta_odb10 |
BUSCO ゲノム | C:98.6%[S:91.5%,D:7.1%],F:0.7%,M:0.7%,n:1614 | BUSCO 遺伝子 (pep/cds) | C:93.6%[S:86.4%,D:7.2%],F:2.1%,M:4.3%,n:1614 |