配列名:CSE_r1.0
ゲノム配列名 | CSE_r1.0 | 系統名 | XMRS10 |
配列数 | 354,212 | 染色体数 | 2n = 2x = 18 |
配列長 (bp) | 2,721,839,164 | N50長 (bp) | 44,741 |
遺伝子の数 | 71,057 | 遺伝子数由来ファイル | CSE_r1.1.pep |
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 | 71,057 | Hayai-Annotation バージョン | zen_v2.0 |
シーケンシングの方法 | Ilumina | 取得した配列量 | 117.3x |
アセンブリ方法 | SOAPdenovo2 r240 | 推定ゲノムサイズ (Mb) | 3,055 |
シーケンシングの方法のコメント | NA | コメント | NA |
論文クレジット情報 | 準備中 | データ/DB クレジット情報 | 準備中 |
責任著者 | Sachiko N. Isobe (Kazusa DNA Research Institute) | データソース名 | Mum GARDEN |
論文 (DOIコード) | 10.1093/dnares/dsy048 | データソースURL | http://mum-garden.kazusa.or.jp/ |
BUSCO バージョン | 5.1.0 | BUSCO データセット | embryophyta_odb10 |
BUSCO ゲノム | C:97.8%[S:88.6%,D:9.2%],F:1.5%,M:0.7%,n:1614 | BUSCO 遺伝子 (pep/cds) | C:90.0%[S:82.6%,D:7.4%],F:2.7%,M:7.3%,n:1614 |