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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Chrysanthemum seticuspe , Wild chrysanthemum (seticuspe) , キクタニギク

Chrysanthemum seticuspe

Genome Assembly ID:t1111766.G001

配列名:CSE_r1.0

ゲノム配列の詳細

配列名 CSE_r1.0 系統名 XMRS10
配列数 354,212 染色体数 2n = 2x = 18
配列長 (bp) 2,721,839,164 N50長 (bp) 44,741
遺伝子の数 71,057 遺伝子数由来ファイル CSE_r1.1.pep
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 71,057 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 Ilumina 取得した配列量 117.3x
アセンブリ方法 SOAPdenovo2 r240 推定ゲノムサイズ (Mb) 3,055
シーケンシングの方法のコメント コメント
論文 (DOIコード) 10.1093/dnares/dsy048 責任著者 Sachiko N. Isobe (Kazusa DNA Research Institute)
データソース名 Mum GARDEN データソースURL http://mum-garden.kazusa.or.jp/
BUSCO バージョン 5.1.0 BUSCO データセット embryophyta_odb10
BUSCO ゲノム C:97.8%[S:88.6%,D:9.2%],F:1.5%,M:0.7%,n:1614 BUSCO 遺伝子 (pep/cds) C:90.0%[S:82.6%,D:7.4%],F:2.7%,M:7.3%,n:1614

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染色体 /
Scaffolds
開始位置
終了位置
相補鎖を出力する
fasta
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