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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Apostasia shenzhenica , Orchids , Apostasia shenzhenica

Apostasia shenzhenica

Genome Assembly ID:t1088818.G001

配列名:ASM278626v1

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 ASM278626v1 系統名 wild type
配列数 2,985 染色体数 2n = 2x = 68
配列長 (bp) 348,733,136 N50長 (bp) 3,029,156
遺伝子の数 21,743 遺伝子数由来ファイル GCA_002786265.1_ASM278626v1_protein.faa.gz
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 21,743 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 Illumina, PacBio RSII, 10x Genomics 取得した配列量 NA
アセンブリ方法 ALLPATHS-LG 推定ゲノムサイズ (Mb) 471
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Zhong-Jian Liu (The National Orchid Conservation Center of China and The Orchid Conservation and Research Center of Shenzhen) データソース名 NCBI
論文 (DOIコード) 10.1038/nature23897 データソースURL https://www.ncbi.nlm.nih.gov/
BUSCO バージョン 5.8.2 BUSCO データセット embryophyta_odb10
BUSCO ゲノム C:95.2%[S:94.1%,D:1.2%],F:2.1%,M:2.7%,n:1614 BUSCO 遺伝子 (pep/cds) C:81.5%[S:80.0%,D:1.4%],F:8.4%,M:10.2%,n:1614

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染色体 /
Scaffolds
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終了位置
相補鎖を出力する
fasta
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