Plant GARDEN 使い方 ▶︎

JA

EN

アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Brachypodium hybridum , Hybridous mediterranean false brome , Brachypodium hybridum

Brachypodium hybridum

Genome Assembly ID:t1071398.G001

配列名:Bhybridum_463_v1.1

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 Bhybridum_463_v1.1 系統名 ABR113
配列数 15 染色体数 2n = 4x = 30
配列長 (bp) 509,216,367 N50長 (bp) 30,611,413
遺伝子の数 70,160 遺伝子数由来ファイル Bhybridum_463_v1.1.protein_primaryTranscriptOnly.fa.gz
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 0 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 Illumina 取得した配列量 28x
アセンブリ方法 Meraculous assembler (2.2.2.5 release) , HiRiseTM 推定ゲノムサイズ (Mb) NA
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 John P. Vogel (University California) データソース名 Phytozome
論文 (DOIコード) 10.1038/s41467-020-17302-5 データソースURL https://phytozome.jgi.doe.gov/pz/portal.html
BUSCO バージョン BUSCO データセット
BUSCO ゲノム BUSCO 遺伝子 (pep/cds)

遺伝子をさがす

遺伝子データは登録されていません。

ゲノム配列を切り出す

染色体 /
Scaffolds
開始位置
終了位置
相補鎖を出力する
fasta
フォーマット