Plant GARDEN 使い方 ▶︎

JA

EN

アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Bruguiera parviflora , Small-leafed orange mangrove , ヒメヒルギ

Bruguiera parviflora

Genome Assembly ID:t106618.G001

配列名:ASM1980459v1

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 ASM1980459v1 系統名 NA
配列数 10,404 染色体数 2n = 2x = 36
配列長 (bp) 210,391,494 N50長 (bp) 10,772,294
遺伝子の数 0 遺伝子数由来ファイル NA
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 0 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 10x Genomics, Illumina 取得した配列量 116.86 Gb
アセンブリ方法 Supernova v2.1.1 推定ゲノムサイズ (Mb) 236
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Sithichoke Tangphatsornruang (National Science and Technology Development Agency) データソース名 NCBI
論文 (DOIコード) 10.1111/1755-0998.13587 データソースURL https://www.ncbi.nlm.nih.gov/
BUSCO バージョン BUSCO データセット
BUSCO ゲノム BUSCO 遺伝子 (pep/cds)

遺伝子をさがす

遺伝子データは登録されていません。

ゲノム配列を切り出す

染色体 /
Scaffolds
開始位置
終了位置
相補鎖を出力する
fasta
フォーマット