Plant GARDEN 使い方 ▶︎

JA

EN

アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Castanea crenata , Japanese chestnut, Kuri , ニホングリ

Castanea crenata

Genome Assembly ID:t103480.G002

配列名:Castanea_crenata

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 Castanea_crenata 系統名 cv. Tsukuba
配列数 12 染色体数 2n = 2x = 24
配列長 (bp) 716,819,419 N50長 (bp) 61,852,783
遺伝子の数 46,463 遺伝子数由来ファイル Castanea_crenata.proteins.fa.gz
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 0 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 Oxford Nanopore, Hi-C 取得した配列量 143x
アセンブリ方法 NECAT v0.01, ALLHiC v0.9.1214 推定ゲノムサイズ (Mb) NA
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Qingzhong Liu (Shandong Institute of Pomology) データソース名 Figshare
論文 (DOIコード) 10.3389/fpls.2022.1049253 データソースURL https://figshare.com
BUSCO バージョン BUSCO データセット
BUSCO ゲノム BUSCO 遺伝子 (pep/cds)

遺伝子をさがす

遺伝子データは登録されていません。

ゲノム配列を切り出す

染色体 /
Scaffolds
開始位置
終了位置
相補鎖を出力する
fasta
フォーマット