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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Castanea crenata , Japanese chestnut, Kuri , ニホングリ

Castanea crenata

Genome Assembly ID:t103480.G001

配列名:CCR_r1.0

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 CCR_r1.0 系統名 Ginyose
配列数 218 染色体数 2n = 2x = 24
配列長 (bp) 721,224,957 N50長 (bp) 53,256,222
遺伝子の数 69,980 遺伝子数由来ファイル CCR1.0.proteins.fasta
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 69,980 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 PacBio 取得した配列量 71.6x
アセンブリ方法 Falcon_Unzip 推定ゲノムサイズ (Mb) 666
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Kenta Shirasawa (Kazusa DNA Research Institute) データソース名 Plant GARDEN
論文 (DOIコード) 10.1101/2021.07.29.454274 データソースURL https://plantgarden.jp/
BUSCO バージョン 5.1.0 BUSCO データセット embryophyta_odb10
BUSCO ゲノム C:97.9%[S:94.4%,D:3.5%],F:1.3%,M:0.8%,n:1614 BUSCO 遺伝子 (pep/cds) C:76.8%[S:73.0%,D:3.8%],F:11.9%,M:11.3%,n:1614

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染色体 /
Scaffolds
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fasta
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