配列名:CCR_r1.0
ゲノム配列名 | CCR_r1.0 | 系統名 | Ginyose |
配列数 | 218 | 染色体数 | 2n = 2x = 24 |
配列長 (bp) | 721,224,957 | N50長 (bp) | 53,256,222 |
遺伝子の数 | 69,980 | 遺伝子数由来ファイル | CCR1.0.proteins.fasta |
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 | 69,980 | Hayai-Annotation バージョン | zen_v2.0 |
シーケンシングの方法 | PacBio | 取得した配列量 | 71.6x |
アセンブリ方法 | Falcon_Unzip | 推定ゲノムサイズ (Mb) | 666 |
シーケンシングの方法のコメント | NA | コメント | NA |
論文クレジット情報 | 準備中 | データ/DB クレジット情報 | 準備中 |
責任著者 | Kenta Shirasawa (Kazusa DNA Research Institute) | データソース名 | Plant GARDEN |
論文 (DOIコード) | 10.1101/2021.07.29.454274 | データソースURL | https://plantgarden.jp/ |
BUSCO バージョン | 5.1.0 | BUSCO データセット | embryophyta_odb10 |
BUSCO ゲノム | C:97.9%[S:94.4%,D:3.5%],F:1.3%,M:0.8%,n:1614 | BUSCO 遺伝子 (pep/cds) | C:76.8%[S:73.0%,D:3.8%],F:11.9%,M:11.3%,n:1614 |