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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Benincasa hispida , Wax gourd , トウガン

Benincasa hispida

Genome Assembly ID:t102211.G001

配列名:GWHAAAR00000000

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 GWHAAAR00000000 系統名 cv. B227
配列数 1,791 染色体数 2n = 2x = 24
配列長 (bp) 912,951,626 N50長 (bp) 69,945,952
遺伝子の数 27,467 遺伝子数由来ファイル GWHAAAR00000000.Protein.faa
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 27,467 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 Illumina 取得した配列量 50.0x
アセンブリ方法 AllPaths v. ALLPATHS-LG-44837 推定ゲノムサイズ (Mb) 1,030
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Biao Jiang (Guangdong Academy of Agricultural Sciences), Zhonghua Zhang (Chinese Academy of Agricultural Sciences) データソース名 Genome Warehouse
論文 (DOIコード) 10.1038/s41467-019-13185-3 データソースURL https://bigd.big.ac.cn/gwh/
BUSCO バージョン 5.1.0 BUSCO データセット embryophyta_odb10
BUSCO ゲノム C:98.9%[S:98.0%,D:0.9%],F:0.1%,M:1.0%,n:1614 BUSCO 遺伝子 (pep/cds) C:95.0%[S:94.2%,D:0.8%],F:2.5%,M:2.5%,n:1614

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染色体 /
Scaffolds
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終了位置
相補鎖を出力する
fasta
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