配列名:Pmume_Tortuosa_v1.0
ゲノム配列名 | Pmume_Tortuosa_v1.0 | 系統名 | var. tortuosa |
配列数 | 32 | 染色体数 | 2n = 2x = 16 |
配列長 (bp) | 237,835,974 | N50長 (bp) | 29,355,377 |
遺伝子の数 | 29,706 | 遺伝子数由来ファイル | Pmume.tortuosa.pep.fasta.gz |
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 | 0 | Hayai-Annotation バージョン | zen_v2.0 |
シーケンシングの方法 | BGI-seq 500, Oxford Nanopore, Hi-C | 取得した配列量 | 168x (BGI), 50x (ONT) |
アセンブリ方法 | SOAPdenovo, SMARTdenovo, Juicer, 3D-DNA | 推定ゲノムサイズ (Mb) | 262 |
シーケンシングの方法のコメント | NA | コメント | NA |
論文クレジット情報 | 準備中 | データ/DB クレジット情報 | 準備中 |
責任著者 | Qixiang Zhang (Beijing Forestry University) | データソース名 | GDR: Genome Database For Rosaceae |
論文 (DOIコード) | 10.1111/nph.17894 | データソースURL | https://www.rosaceae.org/ |
BUSCO バージョン | BUSCO データセット | ||
BUSCO ゲノム | BUSCO 遺伝子 (pep/cds) |