Plant GARDEN 使い方 ▶︎

JA

EN

アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Prunus mume var. tortuosa , Japanese apricot, Ume, Chinese apricot, Mei , ウメ (tortuosa変種)

Prunus mume

Genome Assembly ID:t102107.G002

配列名:Pmume_Tortuosa_v1.0

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 Pmume_Tortuosa_v1.0 系統名 var. tortuosa
配列数 32 染色体数 2n = 2x = 16
配列長 (bp) 237,835,974 N50長 (bp) 29,355,377
遺伝子の数 29,706 遺伝子数由来ファイル Pmume.tortuosa.pep.fasta.gz
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 0 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 BGI-seq 500, Oxford Nanopore, Hi-C 取得した配列量 168x (BGI), 50x (ONT)
アセンブリ方法 SOAPdenovo, SMARTdenovo, Juicer, 3D-DNA 推定ゲノムサイズ (Mb) 262
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Qixiang Zhang (Beijing Forestry University) データソース名 GDR: Genome Database For Rosaceae
論文 (DOIコード) 10.1111/nph.17894 データソースURL https://www.rosaceae.org/
BUSCO バージョン BUSCO データセット
BUSCO ゲノム BUSCO 遺伝子 (pep/cds)

遺伝子をさがす

遺伝子データは登録されていません。

ゲノム配列を切り出す

染色体 /
Scaffolds
開始位置
終了位置
相補鎖を出力する
fasta
フォーマット