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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Prunus mume , Japanese apricot, Ume, Chinese apricot, Mei , ウメ

Prunus mume

Genome Assembly ID:t102107.G001

配列名:P.mume_V1.0

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 P.mume_V1.0 系統名 BJFU1210120008
配列数 8,164 染色体数 2n = 2x = 16
配列長 (bp) 234,030,239 N50長 (bp) 24,358,521
遺伝子の数 29,705 遺伝子数由来ファイル GCF_000346735.1_P.mume_V1.0_protein.faa
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 0 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 Illumina 取得した配列量 180x
アセンブリ方法 SOAPdenovo v. 1.05 推定ゲノムサイズ (Mb) 280
シーケンシングの方法のコメント NA コメント Wild species in Tongmai town, Tibet, China
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Qixiang Zhang (Beijing Forestry University), Tangren Cheng (National Engineering Research Center for Floriculture), Jun Wang (BGI-Shenzhen) データソース名 NCBI
論文 (DOIコード) 10.1038/ncomms2290 データソースURL https://www.ncbi.nlm.nih.gov/
BUSCO バージョン 5.1.0 BUSCO データセット embryophyta_odb10
BUSCO ゲノム C:98.7%[S:96.3%,D:2.4%],F:0.7%,M:0.6%,n:1614 BUSCO 遺伝子 (pep/cds) C:98.6%[S:77.5%,D:21.1%],F:0.8%,M:0.6%,n:1614

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染色体 /
Scaffolds
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fasta
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