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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Digitaria exilis , Fonio millet, Hungry rice , Digitaria exilis

Digitaria exilis

Genome Assembly ID:t1010633.G001

配列名:Fonio_CM05836

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 Fonio_CM05836 系統名 cv. CM05836
配列数 19 染色体数 2n = 4x = 36
配列長 (bp) 716,471,022 N50長 (bp) 40,393,928
遺伝子の数 59,984 遺伝子数由来ファイル Digitaria_exilis.Fonio_CM05836.pep.all.fa.gz
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 0 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 Illumina, 10x Genomics 取得した配列量 321x (Illumina paired-end), 241x (Illumina mate-pair), 84x (10x Genomics), Hi-C, Bionano optical map
アセンブリ方法 DeNovoMAGIC3 推定ゲノムサイズ (Mb) 893
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Simon G. Krattinger (King Abdullah University of Science and Technology (KAUST)) データソース名 NCBI; Ensembl
論文 (DOIコード) 10.1038/s41467-020-18329-4 データソースURL https://www.ncbi.nlm.nih.gov/
http://plants.ensembl.org/index.html
BUSCO バージョン BUSCO データセット
BUSCO ゲノム BUSCO 遺伝子 (pep/cds)

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染色体 /
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