配列名:AYv1.1
ゲノム配列名 | AYv1.1 | 系統名 | ecotype Malutang |
配列数 | 280 | 染色体数 | 2n = 2x = 26 |
配列長 (bp) | 665,887,899 | N50長 (bp) | 44,917,698 |
遺伝子の数 | 28,320 | 遺伝子数由来ファイル | final.gene.pep.faa |
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 | 28,320 | Hayai-Annotation バージョン | zen_v2.0 |
シーケンシングの方法 | PacBio, Sequel | 取得した配列量 | 100x |
アセンブリ方法 | SMARTDENOVO v. 1.0 | 推定ゲノムサイズ (Mb) | 640 |
シーケンシングの方法のコメント | NA | コメント | Tree species endemic to China |
論文クレジット情報 | 準備中 | データ/DB クレジット情報 | 準備中 |
責任著者 | Yongpeng Ma (Chinese Academy of Sciences), Weibang Sun (ditto) | データソース名 | GIGA DB |
論文 (DOIコード) | 10.1093/gigascience/giz085 | データソースURL | http://gigadb.org/ |
BUSCO バージョン | 5.1.0 | BUSCO データセット | embryophyta_odb10 |
BUSCO ゲノム | C:98.7%[S:94.9%,D:3.8%],F:0.6%,M:0.7%,n:1614 | BUSCO 遺伝子 (pep/cds) | C:92.8%[S:89.6%,D:3.2%],F:2.5%,M:4.7%,n:1614 |