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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Acer yangbiense , Chinese Maple , カエデ

Acer yangbiense

Genome Assembly ID:t1000413.G001

配列名:AYv1.1

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 AYv1.1 系統名 ecotype Malutang
配列数 280 染色体数 2n = 2x = 26
配列長 (bp) 665,887,899 N50長 (bp) 44,917,698
遺伝子の数 28,320 遺伝子数由来ファイル final.gene.pep.faa
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 28,320 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 PacBio, Sequel 取得した配列量 100x
アセンブリ方法 SMARTDENOVO v. 1.0 推定ゲノムサイズ (Mb) 640
シーケンシングの方法のコメント NA コメント Tree species endemic to China
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Yongpeng Ma (Chinese Academy of Sciences), Weibang Sun (ditto) データソース名 GIGA DB
論文 (DOIコード) 10.1093/gigascience/giz085 データソースURL http://gigadb.org/
BUSCO バージョン 5.1.0 BUSCO データセット embryophyta_odb10
BUSCO ゲノム C:98.7%[S:94.9%,D:3.8%],F:0.6%,M:0.7%,n:1614 BUSCO 遺伝子 (pep/cds) C:92.8%[S:89.6%,D:3.2%],F:2.5%,M:4.7%,n:1614

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染色体 /
Scaffolds
開始位置
終了位置
相補鎖を出力する
fasta
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