Solanum lycopersicumゲノム配列名:SLYcer_r1.1
遺伝子ファイル名:SLYcer_r1.1.pep.fasta.gz
| 物理上の位置 | 遺伝子名 | CDS | SLYcer04g00530.1 |
| PEP | SLYcer04g00530.1 |
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| ゲノム配列上の位置 | 染色体 | SLYcer1.1ch04 | |
| 開始位置 | 2772734 | ||
| 終了位置 | 2776015 | ||
| 配列の向き | - | ||
| アノテーション情報 (Hayai Annotation ZEN) |
KusakiDB | KusakiDB Accession | KPRO00223719 |
|---|---|---|---|
| KusakiDB バージョン | 2 | ||
| 参照DBにおける蛋白質/転写産物配列の有無 | Yes | ||
| DB間における配列の共通性 | orthodb-refseq-uniprot |
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| OrthoDB | DBのバージョン | 10.1 | |
| 配列の説明 | Leucine-rich repeat |
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| Gene ID | |||
| Ortholog group unique ID | |||
| Functional annotation | 出典元のDB | refseq |
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| 蛋白質名 | probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At3g47570 |
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| Accession | |||
| Uniprotアクセッションに対応するRefseqアクセッション | NA |
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| EC | NA |
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| KEGG エントリー | NA |
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| KO ID | NA |
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| Pfam ID | PF00560,PF08263,PF00069 |
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| Pfam の詳細 | 詳細 | ||
| InterPro ID | IPR001611,IPR000719,IPR013210 |
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| InterPro の詳細 | 詳細 | ||
| GO ID | GO:0005515,GO:0005524,GO:0004672,GO:0006468 |
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| GO の詳細 | 詳細 | ||
| GOslim ID | GO:0043167,GO:0006793,GO:0005515,GO:0006464,GO:0000166,GO:0016740 |
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| GO slim の詳細 | 詳細 | ||
| Transcription Factor (TF) family | NA |
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| TF family の詳細 | NA |
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| Best hit taxonomy | 種 | Solanum lycopersicum | |
| 科 | Solanaceae | ||
| 門 | Streptophyta | ||
| 上界 | Eukaryota | ||
| コメント | |||
