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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Fragaria x ananassa , Strawberry , イチゴ, オランダイチゴ

Fragaria x ananassa

Genome Assembly ID:t3747.G003

配列名:FAN_r2.3

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 FAN_r2.3 系統名 cv. Reikou
配列数 63 染色体数 2n = 8x = 56
配列長 (bp) 1,733,510,992 N50長 (bp) 28,854,432
遺伝子の数 167,721 遺伝子数由来ファイル FAN_r2.3.pep.fa
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 0 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 Illumina PE, MP, 10XGenomics 取得した配列量 86.7x
アセンブリ方法 DenovoMAGIC 3.0 推定ゲノムサイズ (Mb) 708
シーケンシングの方法のコメント NA コメント Haploid resolved genomes
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Sachiko Isobe (Kazusa DNA Research Institute) データソース名 Plant GARDEN
論文 (DOIコード) 10.1101/2021.04.23.441065 データソースURL https://plantgarden.jp/
BUSCO バージョン 5.1.0 BUSCO データセット embryophyta_odb10
BUSCO ゲノム C:99.4%[S:1.5%,D:97.9%],F:0.1%,M:0.5%,n:1614 BUSCO 遺伝子 (pep/cds) C:98.1%[S:2.7%,D:95.4%],F:0.3%,M:1.6%,n:1614

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染色体 /
Scaffolds
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fasta
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