配列名:FAN_r2.3
ゲノム配列名 | FAN_r2.3 | 系統名 | cv. Reikou |
配列数 | 63 | 染色体数 | 2n = 8x = 56 |
配列長 (bp) | 1,733,510,992 | N50長 (bp) | 28,854,432 |
遺伝子の数 | 167,721 | 遺伝子数由来ファイル | FAN_r2.3.pep.fa |
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 | 0 | Hayai-Annotation バージョン | zen_v2.0 |
シーケンシングの方法 | Illumina PE, MP, 10XGenomics | 取得した配列量 | 86.7x |
アセンブリ方法 | DenovoMAGIC 3.0 | 推定ゲノムサイズ (Mb) | 708 |
シーケンシングの方法のコメント | NA | コメント | Haploid resolved genomes |
論文クレジット情報 | 準備中 | データ/DB クレジット情報 | 準備中 |
責任著者 | Sachiko Isobe (Kazusa DNA Research Institute) | データソース名 | Plant GARDEN |
論文 (DOIコード) | 10.1101/2021.04.23.441065 | データソースURL | https://plantgarden.jp/ |
BUSCO バージョン | 5.1.0 | BUSCO データセット | embryophyta_odb10 |
BUSCO ゲノム | C:99.4%[S:1.5%,D:97.9%],F:0.1%,M:0.5%,n:1614 | BUSCO 遺伝子 (pep/cds) | C:98.1%[S:2.7%,D:95.4%],F:0.3%,M:1.6%,n:1614 |