Plant GARDEN
Fragaria x ananassa

Genome Assembly ID:t3747.G002

配列名:Fragaria x ananassa Camarosa gen

ゲノム配列の詳細

学名 Fragaria x ananassa
配列名 Fragaria x ananassa Camarosa gen
系統名 cv. Camarosa
アセンブリレベル Chromosome
配列数 28
染色体数 2n=56
配列長 (bp) 805,488,706
N50長 (bp) 27,809,139
シーケンシングの方法 Illumina, 10X Genomics, PacBio
シーケンシングの方法のコメント
取得した配列量 615x
アセンブリ方法 DenovoMAGIC3, HiRise pipeline, PBJelly
推定ゲノムサイズ (Mb) 813
登録者 Patrick P. Edger, Steven J. Knapp
論文 (DOIコード) 10.1038/s41588-019-0356-4
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遺伝子 (cds / gene)

ゲノム

F_ana_Camarosa_6-28-17.fasta.gz

アノテーション (gff / gff3)

Fxa_v1.2_makerStandard_MakerGenes_woTposases.gff.gz

Hayai Annotation ZEN

Fragaria_x_ananassa_t3747.G002_zen_v1.0.gz

タンパク (pep / aa)

Fxa_v1.2_makerStandard_proteins_woTposases.fasta.gz

トランスクリプト (cDNA / mRNA)

Fxa_v1.2_makerStandard_transcripts_woTposases.fasta.gz

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