Plant GARDEN
Fragaria x ananassa

Genome Assembly ID:t3747.G002

配列名:v1.0.a1

ゲノム配列の詳細

学名 Fragaria x ananassa
配列名 v1.0.a1
系統名 Camarosa
アセンブリレベル Chromosome
配列数 28
染色体数 2n=56
配列長 (bp) 805,488,706
N50長 (bp) 27,809,139
シーケンシングの方法 Illumina, 10X Genomics, PacBio
シーケンシングの方法のコメント NA
取得した配列量 615x
アセンブリ方法 DenovoMAGIC3, HiRise pipeline, PBJelly
推定ゲノムサイズ (Mb) 813
登録者 Edger, P. P. et al.
論文 (DOIコード) 10.1038/s41588-019-0356-4
コメント NA

遺伝子をさがす

遺伝子データは登録されていません。

ゲノム配列を切り出す

染色体 /
Scaffolds
開始位置
終了位置
相補鎖を出力する

その他の配列

配列の種類 ファイル名 ダウンロード コメント

遺伝子 (cds / gene)

ゲノム

F_ana_Camarosa_6-28-17_hardmasked.fasta.gz

アノテーション (gff / gff3)

Fxa_v1.2_makerStandard_MakerGenes_woTposases.gff.gz

Hayai Annotation ZEN

hayai_annotation_zen_PlantGARDEN_Kegg.tsv.gz

タンパク (pep / aa)

Fxa_v1.2_makerStandard_transcripts_woTposases.fasta.gz

トランスクリプト (cDNA / mRNA)

Fxa_v1.2_makerStandard_proteins_woTposases.fasta.gz

;