Plant GARDEN
Arabidopsis thaliana

Genome Assembly ID:t3702.G001

配列名:TAIR10

ゲノム配列の詳細

学名 Arabidopsis thaliana
配列名 TAIR10
系統名 Col-0
アセンブリレベル Chromosome
配列数 7
染色体数 2n=10
配列長 (bp) 119,667,750
N50長 (bp) 23,459,830
シーケンシングの方法 Sanger, Illumina
シーケンシングの方法のコメント NA
取得した配列量 NA
アセンブリ方法 SPAdes, Velvet v. 1.2.10
推定ゲノムサイズ (Mb) 125
登録者 The Arabidopsis Information Resource
論文 (DOIコード) 10.1038/35048692
コメント NA

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染色体 /
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遺伝子 (cds / gene)

Araport11_genes.201606.cds.repr.fasta.gz

ゲノム

TAIR10_Chr.all.fasta.gz

アノテーション (gff / gff3)

Araport11_GFF3_genes_transposons.201606.gff.gz

Hayai Annotation ZEN

hayai_annotation_zen_PlantGARDEN_Kegg.tsv.gz

タンパク (pep / aa)

Araport11_genes.201606.pep.fasta.gz

トランスクリプト (cDNA / mRNA)

Araport11_genes.201606.cdna.fasta.gz

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