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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Coriaria nepalensis , Masuri berry , Coriaria nepalensis

Coriaria nepalensis

Genome Assembly ID:t79760.G001

配列名:Coriaria_nepalensis_genome

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 Coriaria_nepalensis_genome 系統名 NA
配列数 42 染色体数 2n = 40
配列長 (bp) 620,516,538 N50長 (bp) 12,920,479
遺伝子の数 78,425 遺伝子数由来ファイル Coriaria_nepalensis.chr.pep.fa.gz
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 0 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 PacBio Sequel II, Hi-C 取得した配列量 40x (PacBio), 67 Gb (Hi-C)
アセンブリ方法 hifiasm v0.16.1, Juicer v1.6, 3D-DNA 推定ゲノムサイズ (Mb) 313
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Jian-Feng Mao (Ume_ University) データソース名 Figshare
論文 (DOIコード) 10.1038/s41597-023-02171-6 データソースURL https://figshare.com
BUSCO バージョン 5.8.2 BUSCO データセット embryophyta_odb10
BUSCO ゲノム C:98.8%[S:0.7%,D:98.1%],F:0.8%,M:0.4%,n:1614 BUSCO 遺伝子 (pep/cds) C:97.5%[S:2.7%,D:94.8%],F:0.5%,M:2.0%,n:1614

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染色体 /
Scaffolds
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fasta
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