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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Allium cepa , Onion , タマネギ

Allium cepa

Genome Assembly ID:t4679.G001

配列名:Onion v1.2

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 Onion v1.2 系統名 DHCU066619
配列数 89,579 染色体数 2n = 2x = 16
配列長 (bp) 14,937,454,252 N50長 (bp) 464,272
遺伝子の数 86,073 遺伝子数由来ファイル AlliumCepa_v1.2_augustusPredictions.annotated.aa.fa
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 0 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 Illumina HiSeq 2500 取得した配列量 NA
アセンブリ方法 MaSuRCA 2.3.1 推定ゲノムサイズ (Mb) 13,600
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Richard Finkers (Wageningen University and Research Centre) データソース名 Onion Genome Sequencing Project
論文 (DOIコード) 10.1093/g3journal/jkab243 データソースURL https://www.oniongenome.wur.nl/
BUSCO バージョン 5.8.2 BUSCO データセット embryophyta_odb10
BUSCO ゲノム C:90.2%[S:84.6%,D:5.6%],F:5.0%,M:4.8%,n:1614 BUSCO 遺伝子 (pep/cds) C:85.3%[S:80.0%,D:5.2%],F:8.0%,M:6.8%,n:1614

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染色体 /
Scaffolds
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fasta
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