Plant GARDEN 使い方 ▶︎

JA

EN

アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Setaria viridis , Green foxtail , カタバエノコログサ

Setaria viridis

Genome Assembly ID:t4556.G001

配列名:Setaria_viridis_v2.0

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 Setaria_viridis_v2.0 系統名 A10
配列数 15 染色体数 2n = 2x = 18
配列長 (bp) 395,869,604 N50長 (bp) 46,702,114
遺伝子の数 39,206 遺伝子数由来ファイル GCF_005286985.1_Setaria_viridis_v2.0_protein.faa
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 0 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 Illumina 取得した配列量 NA
アセンブリ方法 SOAPdenovo 推定ゲノムサイズ (Mb) 400
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Li-zhi Gao (Kunming University of Science and Technology) データソース名 NCBI
論文 (DOIコード) 10.3109/19401736.2015.1079867 データソースURL https://www.ncbi.nlm.nih.gov/
BUSCO バージョン 5.1.0 BUSCO データセット embryophyta_odb10
BUSCO ゲノム C:98.2%[S:96.4%,D:1.8%],F:0.9%,M:0.9%,n:1614 BUSCO 遺伝子 (pep/cds) C:99.2%[S:72.2%,D:27.0%],F:0.1%,M:0.7%,n:1614

遺伝子をさがす

遺伝子データは登録されていません。

ゲノム配列を切り出す

染色体 /
Scaffolds
開始位置
終了位置
相補鎖を出力する
fasta
フォーマット