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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Kandelia obovata , Qiuqie , メヒルギ

Kandelia obovata

Genome Assembly ID:t413952.G001

配列名:GWHACBH00000000.genome

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 GWHACBH00000000.genome 系統名 wild accession
配列数 74 染色体数 2n = 2x = 36
配列長 (bp) 177,986,124 N50長 (bp) 5,743,053
遺伝子の数 19,138 遺伝子数由来ファイル GWHACBH00000000.Protein.faa.gz
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 19,138 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 Illumina, PacBio, Hi-C 取得した配列量 65.27_Gb(Illumina), 25 Gb(PacBio)
アセンブリ方法 FALCON 推定ゲノムサイズ (Mb) 212
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Zhong-Jian Liu(Fujian Agriculture and Forestry University) データソース名 Genome Whare House
論文 (DOIコード) 10.1038/s41438-020-0300-x データソースURL https://ngdc.cncb.ac.cn/gwh
BUSCO バージョン 5.8.2 BUSCO データセット embryophyta_odb10
BUSCO ゲノム C:98.8%[S:96.8%,D:1.9%],F:0.6%,M:0.6%,n:1614 BUSCO 遺伝子 (pep/cds) C:87.9%[S:86.2%,D:1.7%],F:4.6%,M:7.4%,n:1614

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染色体 /
Scaffolds
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終了位置
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fasta
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