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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Hevea brasiliensis , Rubber tree , パラゴムノキ

Hevea brasiliensis

Genome Assembly ID:t3981.G001

配列名:ASM1045892v1

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 ASM1045892v1 系統名 cv. GT1
配列数 600 染色体数 2n = 2x = 36
配列長 (bp) 1,473,451,759 N50長 (bp) 87,430,961
遺伝子の数 44,146 遺伝子数由来ファイル GCA_010458925.1_ASM1045892v1_protein.faa
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 44,146 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 PacBio RS 取得した配列量 100.0x
アセンブリ方法 FALCON v. 0.0.6 推定ゲノムサイズ (Mb) 2,150
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Xin Liu (BGI-Shenzhen), Li-Zhi Gao (Chinese Academy of Sciences) データソース名 NCBI
論文 (DOIコード) 10.1016/j.molp.2019.10.017 データソースURL https://www.ncbi.nlm.nih.gov/
BUSCO バージョン 5.1.0 BUSCO データセット embryophyta_odb10
BUSCO ゲノム C:96.1%[S:70.8%,D:25.3%],F:1.9%,M:2.0%,n:1614 BUSCO 遺伝子 (pep/cds) C:68.9%[S:55.1%,D:13.8%],F:15.1%,M:16.0%,n:1614

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染色体 /
Scaffolds
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終了位置
相補鎖を出力する
fasta
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