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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Raddia distichophylla , Herbaceous bamboo , Raddia distichophylla

Raddia distichophylla

Genome Assembly ID:t38704.G001

配列名:GWHAAKD00000000.genome

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 GWHAAKD00000000.genome 系統名 wild accession
配列数 38,269 染色体数 NA
配列長 (bp) 580,854,656 N50長 (bp) 1,806,674
遺伝子の数 24,582 遺伝子数由来ファイル GWHAAKD00000000.Protein.faa.gz
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 24,582 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 Illumina 取得した配列量 272.89x(mate-pair and paired-end)
アセンブリ方法 Platanus v1.2.1 推定ゲノムサイズ (Mb) 608(k-mer), 589(flow cytometry)
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Li-Zhi Gao (South China Agricultural University) データソース名 Genome Warehouse
論文 (DOIコード) 10.1093/g3journal/jkaa049 データソースURL https://bigd.big.ac.cn/gwh/
BUSCO バージョン 5.8.2 BUSCO データセット embryophyta_odb10
BUSCO ゲノム C:96.5%[S:92.1%,D:4.3%],F:2.4%,M:1.2%,n:1614 BUSCO 遺伝子 (pep/cds) C:69.9%[S:66.8%,D:3.1%],F:5.3%,M:24.8%,n:1614

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染色体 /
Scaffolds
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fasta
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