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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Raphanus sativus , Japanese radish, Radish , ダイコン

Raphanus sativus

Genome Assembly ID:t3726.G002

配列名:Rs1.0

ゲノム配列の詳細

配列名 Rs1.0 系統名 cv. WK10039
配列数 10,674 染色体数 2n = 2x = 18
配列長 (bp) 426,202,302 N50長 (bp) 38,354,807
遺伝子の数 46,514 遺伝子数由来ファイル Rs_1.0.peptide.fa
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 24,999 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 Sanger, Illumina, 454, SOLiD 取得した配列量 267x
アセンブリ方法 Newbler v. 1.2.3 推定ゲノムサイズ (Mb) 538
シーケンシングの方法のコメント コメント
論文 (DOIコード) 10.1007/s13580-018-0079-y 責任著者 Hee-Ju Yu (The Catholic University of Korea)
データソース名 Radish Genome Database データソースURL http://radish-genome.org/
BUSCO バージョン 5.1.0 BUSCO データセット embryophyta_odb10
BUSCO ゲノム C:97.9%[S:76.9%,D:21.0%],F:1.1%,M:1.0%,n:1614 BUSCO 遺伝子 (pep/cds) C:90.6%[S:69.5%,D:21.1%],F:1.7%,M:7.7%,n:1614

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染色体 /
Scaffolds
開始位置
終了位置
相補鎖を出力する
fasta
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