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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Raphanus sativus , Japanese radish, Radish , ダイコン

Raphanus sativus

Genome Assembly ID:t3726.G001

配列名:RSA_r1.0

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 RSA_r1.0 系統名 cv. Aokubi S-h
配列数 76,592 染色体数 2n = 2x = 18
配列長 (bp) 402,330,269 N50長 (bp) 46,262
遺伝子の数 80,521 遺伝子数由来ファイル RSA_r1.0_pep
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 80,521 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 Sanger, Illumina, PacBio 取得した配列量 246.5x
アセンブリ方法 SOAPdenovo2 r223 推定ゲノムサイズ (Mb) 538
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Takeshi Nishio (Graduate School of Agricultural Science, Tohoku University) データソース名 Raphanus sativus_Genome DataBase
論文 (DOIコード) 10.1093/dnares/dsu014 データソースURL http://radish.kazusa.or.jp/
BUSCO バージョン 5.1.0 BUSCO データセット embryophyta_odb10
BUSCO ゲノム C:94.2%[S:82.3%,D:11.9%],F:4.0%,M:1.8%,n:1614 BUSCO 遺伝子 (pep/cds) C:89.5%[S:79.0%,D:10.5%],F:4.6%,M:5.9%,n:1614

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染色体 /
Scaffolds
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終了位置
相補鎖を出力する
fasta
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