配列名:RSA_r1.0
ゲノム配列名 | RSA_r1.0 | 系統名 | cv. Aokubi S-h |
配列数 | 76,592 | 染色体数 | 2n = 2x = 18 |
配列長 (bp) | 402,330,269 | N50長 (bp) | 46,262 |
遺伝子の数 | 80,521 | 遺伝子数由来ファイル | RSA_r1.0_pep |
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 | 80,521 | Hayai-Annotation バージョン | zen_v2.0 |
シーケンシングの方法 | Sanger, Illumina, PacBio | 取得した配列量 | 246.5x |
アセンブリ方法 | SOAPdenovo2 r223 | 推定ゲノムサイズ (Mb) | 538 |
シーケンシングの方法のコメント | NA | コメント | NA |
論文クレジット情報 | 準備中 | データ/DB クレジット情報 | 準備中 |
責任著者 | Takeshi Nishio (Graduate School of Agricultural Science, Tohoku University) | データソース名 | Raphanus sativus_Genome DataBase |
論文 (DOIコード) | 10.1093/dnares/dsu014 | データソースURL | http://radish.kazusa.or.jp/ |
BUSCO バージョン | 5.1.0 | BUSCO データセット | embryophyta_odb10 |
BUSCO ゲノム | C:94.2%[S:82.3%,D:11.9%],F:4.0%,M:1.8%,n:1614 | BUSCO 遺伝子 (pep/cds) | C:89.5%[S:79.0%,D:10.5%],F:4.6%,M:5.9%,n:1614 |