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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Megacarpaea delavayi , Megacarpaea delavayi , Megacarpaea delavayi

Megacarpaea delavayi

Genome Assembly ID:t264428.G001

配列名:GWHANWI00000000.genome

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 GWHANWI00000000.genome 系統名 wild accession
配列数 286,039 染色体数 2n = 18
配列長 (bp) 819,102,343 N50長 (bp) 74,620
遺伝子の数 43,650 遺伝子数由来ファイル GWHANWI00000000.Protein.faa.gz
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 43,650 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 Illumina 取得した配列量 150x
アセンブリ方法 Platanus v1.2.4 推定ゲノムサイズ (Mb) 899
シーケンシングの方法のコメント They constructed Illumina paired-end libraries with small (230, 500, and 800 bp) and large (2, 5, 10, and 20 kb) insert sizes and read lengths of 150 bp. コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Quanjun Hu(Sichuan University) データソース名 National Genomics Data Center
論文 (DOIコード) 10.3389/fgene.2020.00812 データソースURL https://bigd.big.ac.cn
BUSCO バージョン 5.8.2 BUSCO データセット embryophyta_odb10
BUSCO ゲノム C:96.5%[S:87.0%,D:9.5%],F:2.3%,M:1.2%,n:1614 BUSCO 遺伝子 (pep/cds) C:92.1%[S:64.2%,D:27.9%],F:3.7%,M:4.2%,n:1614

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染色体 /
Scaffolds
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終了位置
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fasta
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