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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Pyrus ussuriensis x communis , Cultivated Ussurian pear , ナシ交雑種 (ussuriensis種 x communis種)

Pyrus ussuriensis x communis

Genome Assembly ID:t2448454.G001

配列名:pZhongai1_v1.0

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 pZhongai1_v1.0 系統名 Zhongai 1
配列数 785 染色体数 2n = 2x = 34
配列長 (bp) 510,637,391 N50長 (bp) 23,451,046
遺伝子の数 43,120 遺伝子数由来ファイル Chr_genomic_genes.gff3.pep.gz
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 0 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 PacBio Sequel 取得した配列量 63.16 Gb
アセンブリ方法 Canu v1.5, WTDBG 推定ゲノムサイズ (Mb) 511
シーケンシングの方法のコメント NA コメント The two assemblies (Canu v1.5 and WTDBG) were merged using Quickmerge software with the contigs from Canu as query input and those from WTDBG as ref input.
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Shuling Jiang (Chinese Academy of Agricultural Sciences) データソース名 GDR: Genome Database For Rosaceae
論文 (DOIコード) 10.1038/s41597-019-0291-3 データソースURL https://www.rosaceae.org/
BUSCO バージョン 5.8.2 BUSCO データセット embryophyta_odb10
BUSCO ゲノム C:92.4%[S:56.5%,D:35.9%],F:1.3%,M:6.3%,n:1614 BUSCO 遺伝子 (pep/cds) NA

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染色体 /
Scaffolds
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相補鎖を出力する
fasta
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