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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Juglans microcarpa x Juglans regia , Walnut rootstock hybrid , クルミ交雑種

Juglans microcarpa x Juglans regia

Genome Assembly ID:t2249226.G001

配列名:Jm3101_v1.0

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 Jm3101_v1.0 系統名 MS1-56
配列数 154 染色体数 2n = 2x = 32
配列長 (bp) 527,895,757 N50長 (bp) 35,629,462
遺伝子の数 43,487 遺伝子数由来ファイル GCF_004785595.1_Jm3101_v1.0_protein.faa.gz
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 43,487 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 PacBio 取得した配列量 47x
アセンブリ方法 FALCON v. 0.4. 推定ゲノムサイズ (Mb) 600
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Jan Dvorak (University of California) データソース名 NCBI
論文 (DOIコード) 10.1038/s41438-019-0139-1 データソースURL https://www.ncbi.nlm.nih.gov/
BUSCO バージョン 5.8.2 BUSCO データセット embryophyta_odb10
BUSCO ゲノム C:98.4%[S:90.6%,D:7.8%],F:1.0%,M:0.6%,n:1614 BUSCO 遺伝子 (pep/cds) C:99.4%[S:58.3%,D:41.1%],F:0.1%,M:0.6%,n:1614

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染色体 /
Scaffolds
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終了位置
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fasta
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