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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Salvia splendens , Scarlet sage , ヒゴロモソウ, サルビア (splendens種)

Salvia splendens

Genome Assembly ID:t180675.G001

配列名:SspV2

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 SspV2 系統名 cv. Aoyunshenghuo (Olympic flame)
配列数 1,178 染色体数 2n = 4x = 44
配列長 (bp) 806,486,317 N50長 (bp) 35,138,742
遺伝子の数 79,326 遺伝子数由来ファイル GCF_004379255.1_SspV2_protein.faa
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 0 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 PacBio; Illumina HiSeq; Hi-C 取得した配列量 82x(PacBio), 40x(Illumina), 105x(Hi-C)
アセンブリ方法 3d-DNA, Juicebox v180922 推定ゲノムサイズ (Mb) 711
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Wei Zhao(Beijing Forestry University), Jian-Feng Mao(Beijing Forestry University) データソース名 NCBI
論文 (DOIコード) 10.1038/s41438-021-00614-y データソースURL https://www.ncbi.nlm.nih.gov/
BUSCO バージョン 5.1.0 BUSCO データセット embryophyta_odb10
BUSCO ゲノム C:98.9%[S:17.8%,D:81.1%],F:0.4%,M:0.7%,n:1614 BUSCO 遺伝子 (pep/cds) C:99.3%[S:13.6%,D:85.7%],F:0.0%,M:0.7%,n:1614

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染色体 /
Scaffolds
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fasta
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