配列名:SspV2
| ゲノム配列名 | SspV2 | 系統名 | cv. Aoyunshenghuo (Olympic flame) |
| 配列数 | 1,178 | 染色体数 | 2n = 4x = 44 |
| 配列長 (bp) | 806,486,317 | N50長 (bp) | 35,138,742 |
| 遺伝子の数 | 79,326 | 遺伝子数由来ファイル | GCF_004379255.1_SspV2_protein.faa |
| Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 | 0 | Hayai-Annotation バージョン | zen_v2.0 |
| シーケンシングの方法 | PacBio; Illumina HiSeq; Hi-C | 取得した配列量 | 82x(PacBio), 40x(Illumina), 105x(Hi-C) |
| アセンブリ方法 | 3d-DNA, Juicebox v180922 | 推定ゲノムサイズ (Mb) | 711 |
| シーケンシングの方法のコメント | NA | コメント | NA |
| 論文クレジット情報 | 準備中 | データ/DB クレジット情報 | 準備中 |
| 責任著者 | Wei Zhao(Beijing Forestry University), Jian-Feng Mao(Beijing Forestry University) | データソース名 | NCBI |
| 論文 (DOIコード) | 10.1038/s41438-021-00614-y | データソースURL | https://www.ncbi.nlm.nih.gov/ |
| BUSCO バージョン | 5.1.0 | BUSCO データセット | embryophyta_odb10 |
| BUSCO ゲノム | C:98.9%[S:17.8%,D:81.1%],F:0.4%,M:0.7%,n:1614 | BUSCO 遺伝子 (pep/cds) | C:99.3%[S:13.6%,D:85.7%],F:0.0%,M:0.7%,n:1614 |