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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Populus wilsonii , Populus wilsonii , Populus wilsonii

Populus wilsonii

Genome Assembly ID:t179741.G001

配列名:Lachesis_assembly_changed

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 Lachesis_assembly_changed 系統名 wild accession
配列数 1,161 染色体数 n = 19
配列長 (bp) 477,349,092 N50長 (bp) 22,202,952
遺伝子の数 38,054 遺伝子数由来ファイル Chr_genome_final_gene.gff3.pep.gz
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 0 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 Illumina, PacBio, Hi-C 取得した配列量 27.37_Gb(Illumina), 475.88_Gb(PacBio), 54.31_Gb(Hi-C)
アセンブリ方法 Hifiasm (V 0.12) 推定ゲノムサイズ (Mb) 439.39_
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Shengkui Zhang (Qilu University of Technology) データソース名 FIgshare
論文 (DOIコード) 10.1038/s42003-022-04106-0 データソースURL https://figshare.com
BUSCO バージョン 5.8.2 BUSCO データセット embryophyta_odb10
BUSCO ゲノム C:98.7%[S:82.2%,D:16.5%],F:0.7%,M:0.6%,n:1614 BUSCO 遺伝子 (pep/cds) NA

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染色体 /
Scaffolds
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fasta
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