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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Acer catalpifolium , Maple , カエデ (catalpifolium属)

Acer catalpifolium

Genome Assembly ID:t1642853.G001

配列名:GWHASIS00000000.genome

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 GWHASIS00000000.genome 系統名 wild accession
配列数 1,978 染色体数 NA
配列長 (bp) 654,514,841 N50長 (bp) 37,579,358
遺伝子の数 35,132 遺伝子数由来ファイル GWHASIS00000000.Protein.faa.gz
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 35,132 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 PacBio, Illumina, Hi-C 取得した配列量 34.49 Gb(PacBio), 34.40 Gb(Illumina), 45.55 Gb(Hi-C)
アセンブリ方法 Canu (v1.5) 推定ゲノムサイズ (Mb) NA
シーケンシングの方法のコメント NA コメント Synonym: Acer longipes
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Xin Yi(The Chinese Academy of Sciences) データソース名 Genome Warehouse
論文 (DOIコード) 10.1093/gbe/evab271 データソースURL https://bigd.big.ac.cn/gwh/
BUSCO バージョン 5.8.2 BUSCO データセット embryophyta_odb10
BUSCO ゲノム C:97.0%[S:90.1%,D:6.9%],F:0.6%,M:2.4%,n:1614 BUSCO 遺伝子 (pep/cds) C:96.6%[S:89.5%,D:7.1%],F:1.1%,M:2.3%,n:1614

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染色体 /
Scaffolds
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終了位置
相補鎖を出力する
fasta
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