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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Prunus davidiana , Chinese wild peach, David's peach , シダレモウコアンズ, サントウ

Prunus davidiana

Genome Assembly ID:t151430.G002

配列名:pdavidiana_v2.0

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 pdavidiana_v2.0 系統名 wild accessions Hong Hua Shan Tao
配列数 564 染色体数 2n = 2x = 16
配列長 (bp) 259,268,896 N50長 (bp) 28,549,251
遺伝子の数 27,236 遺伝子数由来ファイル Pda.update.pep.gz
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 0 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 PacBio Sequel II, Hi-C 取得した配列量 574.84x
アセンブリ方法 Hifiasm v0.13-r308, ALLHiC 推定ゲノムサイズ (Mb) 237
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Lirong Wang (Chinese Academy of Agricultural Sciences) データソース名 GDR: Genome Database For Rosaceae
論文 (DOIコード) 10.1186/s12915-022-01342-y データソースURL https://www.rosaceae.org/
BUSCO バージョン 5.8.2 BUSCO データセット embryophyta_odb10
BUSCO ゲノム C:99.1%[S:96.9%,D:2.2%],F:0.5%,M:0.4%,n:1614 BUSCO 遺伝子 (pep/cds) C:97.4%[S:95.3%,D:2.1%],F:1.4%,M:1.2%,n:1614

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染色体 /
Scaffolds
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終了位置
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fasta
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