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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Alliaria petiolata , Garlic mustard , ニンニクガラシ

Alliaria petiolata

Genome Assembly ID:t126270.G001

配列名:GCA_020283515.1_Apet_EFCC3-3-20v4_genomic

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 GCA_020283515.1_Apet_EFCC3-3-20v4_genomic 系統名 S1 generation of EFCC3-3-20
配列数 694 染色体数 NA
配列長 (bp) 1,075,010,735 N50長 (bp) 121,941,980
遺伝子の数 0 遺伝子数由来ファイル NA
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 0 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 Illumina 取得した配列量 7.9_Gb(paired-end), 45.8_Gb(mate-pair)
アセンブリ方法 ALLPATHS-LG version R52488 推定ゲノムサイズ (Mb) 1,350
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Robert I Colautti (Queen's University) データソース名 NCBI
論文 (DOIコード) 10.1093/g3journal/jkab339 データソースURL https://www.ncbi.nlm.nih.gov/
BUSCO バージョン 5.8.2 BUSCO データセット embryophyta_odb10
BUSCO ゲノム C:98.8%[S:21.7%,D:77.1%],F:0.6%,M:0.6%,n:1614 BUSCO 遺伝子 (pep/cds) NA

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染色体 /
Scaffolds
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fasta
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