Gene sequences

How To ▶︎

JA

EN

TOP > About the Species(Solanum lycopersicum ) > genome data >Gene sequences

Search

By Traits

Let’s Analyze!!

SNP Detection
(lang=JA only)

Other Tools

Data List

All

Trait-Related Loci

Solanum lycopersicum

CDS Sequence

CDS ID	Solyc01g094850.2.1
CDS Infomation	Pentatricopeptide repeat superfamily protein, putative (AHRD V3.3 *** A0A061DV06_THECC)
Sequence	ATGGGCGATCTTGATGAAGGGAAATGTATACATGGAAATGTTATTAAGTTGGGTATGACT GATGTTCTTTCTTTGGGAAATCAGCTCTTGAGAGTTTATGTAAAATGTATGAAGTTTGTT GATGCGTGCAAGGTGTTCGATGAAATGTGTGTAAGAAATATTGTTACTTGGAATACGTTG ATATGTGGTTTAAGGTACTCTGCTGAGACAAATGGTTATCTGGGGTTCTGTTATTTCAAG AAAATGTTGATGGAATCGGTGTCTCCTGATTGCATTACTTTCTGTGGGTTGCTCCGACTT TGTGTGGAGTTAAAGGGTGGTGTTTGGTTGGTCAAGGAGTTGCATTCTGCTATCGTGAAG TTGGGATATGATCAAAGTTGTTTTCTTGGTGGGACTCTTGTTGATGTGTATGGGAAGTTT GGGTTGATTGGAGAGGCTAGGTGTGTTCTTGATGGGGTTTTGGCGCGTGATTTAGTGTTA TGGAATGTTATGATTTCTTGCTATGTAGTGAATGGTCTGGGTGAAGAGGCTTTTTGGTTA TTCAGTTTGATGAGATCGGAGGGGTTTGAGGGGGATGAGTTTACATTTGCTAGTCTACTT AATTCATGTGCTAGTTTGGGGTTCTATGACTCAGGTAGGCAGATCCAAGGTCTTGTTATT AAAGCTTGCTTTAACAAGGATGTGGTGGTTGAAAGTGCACTTGTTGATATGTATGCAAAG AATGAACATATAACCGATGCTCGCAAGGCTTTTGATGCAATGGCCTTCAGAAATGTAGTC TCTTGGACCACTATTATTGTAGGTTATGGACGTCGTGGAGATGGGAAGGAAGCTATGGAA CTTCTAAAAAGGATGGTAAGAGAGGATTTTGTTCCTGATGAGCTCACTTTGGCTAGTGTT CTTAGTTCATGTGGTAACTTATCAATGGCCACTGAAACTGTACAAGTTCATGCTTATGCA GTTAAATATGTATTCTCAAATTCTATATCAATTGGAAATGCATTGATAAATGCATACTCA AAGTGTGGCAGTATAGCTCATGCTTACCAGTCCTTCAGCTCAATAAAAGCACCAGATCTT TTTTCATGGACCTCAATGATTGGAGCTTATGCATCCCATGGCTTTTCAAAGGAAGCTATT CAACTTTTTGAGGAAATGTTGGAAAATAGTGTGATGCCAGATAGTATTGTATTTCTAGAG GTTCTCTCTGCCTGTAGCCATGGTGGTCTCTTTAGTAAAGGGCTGCAGTACTTCAGTTTG ATGACGAATAACTACCAAATTGTGCCAAGCTCAGAACACTATACCTGTCTCATAGATCTT TTTGGACGATTGGGCCTTCTAGATGAGGCTTATGAAGTTCTAAACTCAATGCCAGTTGAA TCCCAACCAGATGCCCTGAAGGCTTTCGTTGGCGCTTGTAGAATCCATGGCGATGTGAAA TTGGCAAAATGGGCCGCAGAAAAGCTATTCGTGATAGATCCAACTGATACCGCTACTTAC GTCCAGATGTCAAACTTGTGCGCCTCTGATAGTAATTGGCCTGATGCAGCCTTGATCTGG GAAATGGCTAGAGAGCGGTTGCATAACAAATCACCAGGCTGTAGCATGGAAATTATTACT CATGGAATCAACACATTAAGCAACTAA

Peptide Sequence

PEP ID	Solyc01g094850.2.1
PEP Infomation	Pentatricopeptide repeat superfamily protein, putative (AHRD V3.3 *** A0A061DV06_THECC)
Sequence	MGDLDEGKCIHGNVIKLGMTDVLSLGNQLLRVYVKCMKFVDACKVFDEMCVRNIVTWNTL ICGLRYSAETNGYLGFCYFKKMLMESVSPDCITFCGLLRLCVELKGGVWLVKELHSAIVK LGYDQSCFLGGTLVDVYGKFGLIGEARCVLDGVLARDLVLWNVMISCYVVNGLGEEAFWL FSLMRSEGFEGDEFTFASLLNSCASLGFYDSGRQIQGLVIKACFNKDVVVESALVDMYAK NEHITDARKAFDAMAFRNVVSWTTIIVGYGRRGDGKEAMELLKRMVREDFVPDELTLASV LSSCGNLSMATETVQVHAYAVKYVFSNSISIGNALINAYSKCGSIAHAYQSFSSIKAPDL FSWTSMIGAYASHGFSKEAIQLFEEMLENSVMPDSIVFLEVLSACSHGGLFSKGLQYFSL MTNNYQIVPSSEHYTCLIDLFGRLGLLDEAYEVLNSMPVESQPDALKAFVGACRIHGDVK LAKWAAEKLFVIDPTDTATYVQMSNLCASDSNWPDAALIWEMARERLHNKSPGCSMEIIT HGINTLSN*

Transcript Sequence

Transcript ID	Solyc01g094850.2.1
Transcript Infomation	Pentatricopeptide repeat superfamily protein, putative (AHRD V3.3 *** A0A061DV06_THECC)
Sequence	ATGGGCGATCTTGATGAAGGGAAATGTATACATGGAAATGTTATTAAGTTGGGTATGACT GATGTTCTTTCTTTGGGAAATCAGCTCTTGAGAGTTTATGTAAAATGTATGAAGTTTGTT GATGCGTGCAAGGTGTTCGATGAAATGTGTGTAAGAAATATTGTTACTTGGAATACGTTG ATATGTGGTTTAAGGTACTCTGCTGAGACAAATGGTTATCTGGGGTTCTGTTATTTCAAG AAAATGTTGATGGAATCGGTGTCTCCTGATTGCATTACTTTCTGTGGGTTGCTCCGACTT TGTGTGGAGTTAAAGGGTGGTGTTTGGTTGGTCAAGGAGTTGCATTCTGCTATCGTGAAG TTGGGATATGATCAAAGTTGTTTTCTTGGTGGGACTCTTGTTGATGTGTATGGGAAGTTT GGGTTGATTGGAGAGGCTAGGTGTGTTCTTGATGGGGTTTTGGCGCGTGATTTAGTGTTA TGGAATGTTATGATTTCTTGCTATGTAGTGAATGGTCTGGGTGAAGAGGCTTTTTGGTTA TTCAGTTTGATGAGATCGGAGGGGTTTGAGGGGGATGAGTTTACATTTGCTAGTCTACTT AATTCATGTGCTAGTTTGGGGTTCTATGACTCAGGTAGGCAGATCCAAGGTCTTGTTATT AAAGCTTGCTTTAACAAGGATGTGGTGGTTGAAAGTGCACTTGTTGATATGTATGCAAAG AATGAACATATAACCGATGCTCGCAAGGCTTTTGATGCAATGGCCTTCAGAAATGTAGTC TCTTGGACCACTATTATTGTAGGTTATGGACGTCGTGGAGATGGGAAGGAAGCTATGGAA CTTCTAAAAAGGATGGTAAGAGAGGATTTTGTTCCTGATGAGCTCACTTTGGCTAGTGTT CTTAGTTCATGTGGTAACTTATCAATGGCCACTGAAACTGTACAAGTTCATGCTTATGCA GTTAAATATGTATTCTCAAATTCTATATCAATTGGAAATGCATTGATAAATGCATACTCA AAGTGTGGCAGTATAGCTCATGCTTACCAGTCCTTCAGCTCAATAAAAGCACCAGATCTT TTTTCATGGACCTCAATGATTGGAGCTTATGCATCCCATGGCTTTTCAAAGGAAGCTATT CAACTTTTTGAGGAAATGTTGGAAAATAGTGTGATGCCAGATAGTATTGTATTTCTAGAG GTTCTCTCTGCCTGTAGCCATGGTGGTCTCTTTAGTAAAGGGCTGCAGTACTTCAGTTTG ATGACGAATAACTACCAAATTGTGCCAAGCTCAGAACACTATACCTGTCTCATAGATCTT TTTGGACGATTGGGCCTTCTAGATGAGGCTTATGAAGTTCTAAACTCAATGCCAGTTGAA TCCCAACCAGATGCCCTGAAGGCTTTCGTTGGCGCTTGTAGAATCCATGGCGATGTGAAA TTGGCAAAATGGGCCGCAGAAAAGCTATTCGTGATAGATCCAACTGATACCGCTACTTAC GTCCAGATGTCAAACTTGTGCGCCTCTGATAGTAATTGGCCTGATGCAGCCTTGATCTGG GAAATGGCTAGAGAGCGGTTGCATAACAAATCACCAGGCTGTAGCATGGAAATTATTACT CATGGAATCAACACATTAAGCAACTAA