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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Glycine max , Soybean , ダイズ

Glycine max

Genome Assembly ID:t3847.G003

配列名:Gmax_ZH13

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 Gmax_ZH13 系統名 cv. Zhonghuang 13
配列数 570 染色体数 2n = 2x = 40
配列長 (bp) 1,020,296,243 N50長 (bp) 51,865,536
遺伝子の数 58,017 遺伝子数由来ファイル GWHAAEV00000000.Protein.faa
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 58,017 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 Illumina, PacBio 取得した配列量 250x
アセンブリ方法 HGAP v. 2017-05, Bionano optical map v. 2017-05 推定ゲノムサイズ (Mb) 1,100
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Zhixi Tian (Chinese Academy of Sciences), Shisong Ma (University of Science and Technology of China), Jianchang Du (Jiangsu Academy of Agricultural Sciences) データソース名 Genome Warehouse
論文 (DOIコード) 10.1007/s11427-018-9360-0 データソースURL https://bigd.big.ac.cn/gwh/
BUSCO バージョン 5.1.0 BUSCO データセット embryophyta_odb10
BUSCO ゲノム C:99.4%[S:42.6%,D:56.8%],F:0.3%,M:0.3%,n:1614 BUSCO 遺伝子 (pep/cds) C:98.8%[S:40.1%,D:58.7%],F:0.9%,M:0.3%,n:1614

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染色体 /
Scaffolds
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終了位置
相補鎖を出力する
fasta
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