Plant GARDEN
Glycine max

Genome Assembly ID:t3847.G002

配列名:Lee.gnm1

ゲノム配列の詳細

学名 Glycine max
配列名 Lee.gnm1
系統名 Lee
アセンブリレベル Chromosome
配列数 292
染色体数 2n=40
配列長 (bp) 1,016,275,704
N50長 (bp) 50,397,291
シーケンシングの方法 Illumina, PacBio
シーケンシングの方法のコメント NA
取得した配列量 290x
アセンブリ方法 PacBio Falcon v. 2016-06, BioNano optical map v. 2016-07, DeNovoMAGIC v. 2016-08
推定ゲノムサイズ (Mb) 1,100
登録者 Glycine max cv Lee and Glycine soja PI 483463 sequencing consortium
論文 (DOIコード) NA
コメント NA

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染色体 /
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配列の種類 ファイル名 ダウンロード コメント

遺伝子 (cds / gene)

glyma.Lee.gnm1.ann1.6NZV.cds.fna.gz

ゲノム

glyma.Lee.gnm1.BXNC.genome_main.fna.gz

アノテーション (gff / gff3)

glyma.Lee.gnm1.ann1.6NZV.gene_models_main.gff3.gz

Hayai Annotation ZEN

hayai_annotation_zen_PlantGARDEN_Kegg.tsv.gz

タンパク (pep / aa)

glyma.Lee.gnm1.ann1.6NZV.protein.faa.gz

トランスクリプト (cDNA / mRNA)

glyma.Lee.gnm1.ann1.6NZV.transcript.fna.gz

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