配列名:Lee.gnm1
ゲノム配列名 | Lee.gnm1 | 系統名 | cv. Lee |
配列数 | 292 | 染色体数 | 2n = 2x = 40 |
配列長 (bp) | 1,016,275,704 | N50長 (bp) | 50,397,291 |
遺伝子の数 | 71,358 | 遺伝子数由来ファイル | glyma.Lee.gnm1.ann1.6NZV.protein.faa |
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 | 71,358 | Hayai-Annotation バージョン | zen_v2.0 |
シーケンシングの方法 | Illumina, PacBio | 取得した配列量 | 290x |
アセンブリ方法 | PacBio Falcon v. 2016-06, BioNano optical map v. 2016-07, DeNovoMAGIC v. 2016-08 | 推定ゲノムサイズ (Mb) | 1,100 |
シーケンシングの方法のコメント | NA | コメント | NA |
論文クレジット情報 | 準備中 | データ/DB クレジット情報 | 準備中 |
責任著者 | Henry T. Nguyen (University of Missouri) | データソース名 | SoyBase |
論文 (DOIコード) | 10.1111/tpj.14500 | データソースURL | https://www.soybase.org/ |
BUSCO バージョン | 5.1.0 | BUSCO データセット | embryophyta_odb10 |
BUSCO ゲノム | C:99.5%[S:43.0%,D:56.5%],F:0.2%,M:0.3%,n:1614 | BUSCO 遺伝子 (pep/cds) | C:99.4%[S:30.4%,D:69.0%],F:0.6%,M:0.0%,n:1614 |