配列名:Glycine_max_v2.1
ゲノム配列名 | Glycine_max_v2.1 | 系統名 | cv. Williams 82 |
配列数 | 1,190 | 染色体数 | 2n = 2x = 40 |
配列長 (bp) | 978,491,270 | N50長 (bp) | 48,577,505 |
遺伝子の数 | 88,412 | 遺伝子数由来ファイル | Glycine_max.Glycine_max_v2.1.pep.all.fa |
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 | 88,412 | Hayai-Annotation バージョン | zen_v2.0 |
シーケンシングの方法 | ABI 3739 | 取得した配列量 | 8.05x |
アセンブリ方法 | ARACHNE v. 200721016_modified | 推定ゲノムサイズ (Mb) | 1,100 |
シーケンシングの方法のコメント | NA | コメント | NA |
論文クレジット情報 | 準備中 | データ/DB クレジット情報 | 準備中 |
責任著者 | Scott A. Jackson (Purdue University) | データソース名 | Ensembl |
論文 (DOIコード) | 10.1038/nature08670 | データソースURL | http://plants.ensembl.org/index.html |
BUSCO バージョン | 5.1.0 | BUSCO データセット | embryophyta_odb10 |
BUSCO ゲノム | C:99.4%[S:43.1%,D:56.3%],F:0.3%,M:0.3%,n:1614 | BUSCO 遺伝子 (pep/cds) | C:99.3%[S:25.2%,D:74.1%],F:0.4%,M:0.3%,n:1614 |