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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Glycine max , Soybean , ダイズ

Glycine max

Genome Assembly ID:t3847.G001

配列名:Glycine_max_v2.1

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 Glycine_max_v2.1 系統名 cv. Williams 82
配列数 1,190 染色体数 2n = 2x = 40
配列長 (bp) 978,491,270 N50長 (bp) 48,577,505
遺伝子の数 88,412 遺伝子数由来ファイル Glycine_max.Glycine_max_v2.1.pep.all.fa
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 88,412 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 ABI 3739 取得した配列量 8.05x
アセンブリ方法 ARACHNE v. 200721016_modified 推定ゲノムサイズ (Mb) 1,100
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Scott A. Jackson (Purdue University) データソース名 Ensembl
論文 (DOIコード) 10.1038/nature08670 データソースURL http://plants.ensembl.org/index.html
BUSCO バージョン 5.1.0 BUSCO データセット embryophyta_odb10
BUSCO ゲノム C:99.4%[S:43.1%,D:56.3%],F:0.3%,M:0.3%,n:1614 BUSCO 遺伝子 (pep/cds) C:99.3%[S:25.2%,D:74.1%],F:0.4%,M:0.3%,n:1614

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染色体 /
Scaffolds
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終了位置
相補鎖を出力する
fasta
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