Plant GARDEN
Glycine max

Genome Assembly ID:t3847.G001

配列名:Glycine_max_v2.1

ゲノム配列の詳細

学名 Glycine max
配列名 Glycine_max_v2.1
系統名 Williams 82
アセンブリレベル Chromosome
配列数 1,190
染色体数 2n=40
配列長 (bp) 978,491,270
N50長 (bp) 48,577,505
シーケンシングの方法 ABI 3739
シーケンシングの方法のコメント NA
取得した配列量 8.05x
アセンブリ方法 ARACHNE v. 200721016_modified
推定ゲノムサイズ (Mb) 1,100
登録者 Joint Genome Institute
論文 (DOIコード) 10.1038/nature08670
コメント NA

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染色体 /
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配列の種類 ファイル名 ダウンロード コメント

遺伝子 (cds / gene)

Glycine_max.Glycine_max_v2.1.cds.all.fa.gz

ゲノム

Glycine_max.Glycine_max_v2.1.dna.toplevel.fa.gz

アノテーション (gff / gff3)

Glycine_max.Glycine_max_v2.1.42.chr.gff3.gz

Hayai Annotation ZEN

hayai_annotation_zen_PlantGARDEN_Kegg.tsv.gz

タンパク (pep / aa)

Glycine_max.Glycine_max_v2.1.pep.all.fa.gz

トランスクリプト (cDNA / mRNA)

Glycine_max.Glycine_max_v2.1.cdna.all.fa.gz

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