Plant GARDEN
Arachis hypogaea

Genome Assembly ID:t3818.G001

配列名:Tifrunner.gnm1.KYV3

ゲノム配列の詳細

学名 Arachis hypogaea
配列名 Tifrunner.gnm1.KYV3
系統名 Tifrunner
アセンブリレベル Chromosome
配列数 384
染色体数 2n=40
配列長 (bp) 2,556,916,893
N50長 (bp) 135,150,084
シーケンシングの方法 PacBio
シーケンシングの方法のコメント NA
取得した配列量 48x
アセンブリ方法 MECAT v. 2017-07, Arrow v. 2017-07
推定ゲノムサイズ (Mb) 2,807
登録者 International Peanut Genome Initiative
論文 (DOIコード) NA
コメント NA

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染色体 /
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配列の種類 ファイル名 ダウンロード コメント

遺伝子 (cds / gene)

arahy.Tifrunner.gnm1.ann1.CCJH.cds.fna.gz

ゲノム

arahy.Tifrunner.gnm1.KYV3.genome_main.fna.gz

アノテーション (gff / gff3)

arahy.Tifrunner.gnm1.ann1.CCJH.gene_models_main.gff3.gz

Hayai Annotation ZEN

hayai_annotation_zen_PlantGARDEN_Kegg.tsv.gz

タンパク (pep / aa)

arahy.Tifrunner.gnm1.ann1.CCJH.protein.faa.gz

トランスクリプト (cDNA / mRNA)

arahy.Tifrunner.gnm1.ann1.CCJH.transcript.fna.gz

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