配列名:FANhybrid_r1.2
ゲノム配列名 | FANhybrid_r1.2 | 系統名 | cv. Reikou |
配列数 | 211,588 | 染色体数 | 2n = 8x = 56 |
配列長 (bp) | 173,229,572 | N50長 (bp) | 5,137 |
遺伝子の数 | 45,377 | 遺伝子数由来ファイル | FANhybrid_r1.2.pep |
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 | 45,377 | Hayai-Annotation バージョン | zen_v2.0 |
シーケンシングの方法 | Illumina, 454 | 取得した配列量 | 402.6x |
アセンブリ方法 | Newbler 2.7, SOAPdenovo v1.05 | 推定ゲノムサイズ (Mb) | 720 |
シーケンシングの方法のコメント | NA | コメント | NA |
論文クレジット情報 | 準備中 | データ/DB クレジット情報 | 準備中 |
責任著者 | Sachiko N. Isobe (Kazusa DNA Research Institute) | データソース名 | Strawberry GARDEN |
論文 (DOIコード) | 10.1093/dnares/dst049 | データソースURL | http://strawberry-garden.kazusa.or.jp/ |
BUSCO バージョン | 5.1.0 | BUSCO データセット | embryophyta_odb10 |
BUSCO ゲノム | C:68.6%[S:67.7%,D:0.9%],F:18.0%,M:13.4%,n:1614 | BUSCO 遺伝子 (pep/cds) | C:60.3%[S:58.9%,D:1.4%],F:22.2%,M:17.5%,n:1614 |