Plant GARDEN
Fragaria x ananassa

Genome Assembly ID:t3747.G001

配列名:FANhybrid_r1.2

ゲノム配列の詳細

学名 Fragaria x ananassa
配列名 FANhybrid_r1.2
系統名 Reikou
アセンブリレベル Scaffold
配列数 211,588
染色体数 2n=56
配列長 (bp) 173,229,572
N50長 (bp) 5,137
シーケンシングの方法 Illumina, 454
シーケンシングの方法のコメント NA
取得した配列量 402.6x
アセンブリ方法 Newbler 2.7, SOAPdenovo v1.05
推定ゲノムサイズ (Mb) 597
登録者 Kazusa DNA Research Institute
論文 (DOIコード) 10.1093/dnares/dst049
コメント NA

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染色体 /
Scaffolds
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その他の配列

配列の種類 ファイル名 ダウンロード コメント

遺伝子 (cds / gene)

FANhybrid_r1.2.cds.gz

ゲノム

FANhybrid_r1.2.gz

アノテーション (gff / gff3)

FANhybrid_r1.2.genes.gff3.gz

Hayai Annotation ZEN

hayai_annotation_zen_PlantGARDEN_Kegg.tsv.gz

タンパク (pep / aa)

FANhybrid_r1.2.pep.gz

トランスクリプト (cDNA / mRNA)

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