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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Fragaria x ananassa , Strawberry , イチゴ, オランダイチゴ

Fragaria x ananassa

Genome Assembly ID:t3747.G001

配列名:FANhybrid_r1.2

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 FANhybrid_r1.2 系統名 cv. Reikou
配列数 211,588 染色体数 2n = 8x = 56
配列長 (bp) 173,229,572 N50長 (bp) 5,137
遺伝子の数 45,377 遺伝子数由来ファイル FANhybrid_r1.2.pep
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 45,377 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 Illumina, 454 取得した配列量 402.6x
アセンブリ方法 Newbler 2.7, SOAPdenovo v1.05 推定ゲノムサイズ (Mb) 720
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Sachiko N. Isobe (Kazusa DNA Research Institute) データソース名 Strawberry GARDEN
論文 (DOIコード) 10.1093/dnares/dst049 データソースURL http://strawberry-garden.kazusa.or.jp/
BUSCO バージョン 5.1.0 BUSCO データセット embryophyta_odb10
BUSCO ゲノム C:68.6%[S:67.7%,D:0.9%],F:18.0%,M:13.4%,n:1614 BUSCO 遺伝子 (pep/cds) C:60.3%[S:58.9%,D:1.4%],F:22.2%,M:17.5%,n:1614

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染色体 /
Scaffolds
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fasta
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