配列名:Rs1.0
ゲノム配列名 | Rs1.0 | 系統名 | cv. WK10039 |
配列数 | 10,674 | 染色体数 | 2n = 2x = 18 |
配列長 (bp) | 426,202,302 | N50長 (bp) | 38,354,807 |
遺伝子の数 | 46,514 | 遺伝子数由来ファイル | Rs_1.0.peptide.fa |
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 | 46,514 | Hayai-Annotation バージョン | zen_v2.0 |
シーケンシングの方法 | Sanger, Illumina, 454, SOLiD | 取得した配列量 | 267x |
アセンブリ方法 | Newbler v. 1.2.3 | 推定ゲノムサイズ (Mb) | 538 |
シーケンシングの方法のコメント | NA | コメント | NA |
論文クレジット情報 | 準備中 | データ/DB クレジット情報 | 準備中 |
責任著者 | Hee-Ju Yu (The Catholic University of Korea) | データソース名 | Radish Genome Database |
論文 (DOIコード) | 10.1007/s13580-018-0079-y | データソースURL | http://radish-genome.org/ |
BUSCO バージョン | 5.1.0 | BUSCO データセット | embryophyta_odb10 |
BUSCO ゲノム | C:97.9%[S:76.9%,D:21.0%],F:1.1%,M:1.0%,n:1614 | BUSCO 遺伝子 (pep/cds) | C:90.6%[S:69.5%,D:21.1%],F:1.7%,M:7.7%,n:1614 |