Plant GARDEN
Raphanus sativus

Genome Assembly ID:t3726.G002

配列名:Rs1.0

ゲノム配列の詳細

学名 Raphanus sativus
配列名 Rs1.0
系統名 WK10039
アセンブリレベル Chromosome
配列数 10,674
染色体数 2n=18
配列長 (bp) 426,202,302
N50長 (bp) 38,354,807
シーケンシングの方法 "Sanger, Illumina, 454, SOLiD"
シーケンシングの方法のコメント NA
取得した配列量 267x
アセンブリ方法 Newbler v. 1.2.3
推定ゲノムサイズ (Mb) 538
登録者 Dr. Namshin Kim at KRIBB
論文 (DOIコード) 10.1007/s13580-018-0079-y
コメント NA

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その他の配列

配列の種類 ファイル名 ダウンロード コメント

遺伝子 (cds / gene)

Rs_1.0.cds.fa.gz

ゲノム

Rs_1.0.chromosomes.fix.fasta.gz

アノテーション (gff / gff3)

Rs_1.0.Gene.LFY.gff.gz

Hayai Annotation ZEN

hayai_annotation_zen_PlantGARDEN_Kegg.tsv.gz

タンパク (pep / aa)

Rs_1.0.peptide.fa.gz

トランスクリプト (cDNA / mRNA)

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