Plant GARDEN
Raphanus sativus

Genome Assembly ID:t3726.G002

配列名:Rs1.0

ゲノム配列の詳細

学名 Raphanus sativus
配列名 Rs1.0
系統名 cv. WK10039
アセンブリレベル Chromosome
配列数 10,674
染色体数 2n=18
配列長 (bp) 426,202,302
N50長 (bp) 38,354,807
シーケンシングの方法 Sanger, Illumina, 454, SOLiD
シーケンシングの方法のコメント
取得した配列量 267x
アセンブリ方法 Newbler v. 1.2.3
推定ゲノムサイズ (Mb) 538
登録者
論文 (DOIコード) 10.1007/s13580-018-0079-y
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染色体 /
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配列の種類 ファイル名 ダウンロード コメント

遺伝子 (cds / gene)

Rs_1.0.cds.fa.gz

ゲノム

Rs_1.0.chromosomes.fix.fasta.gz

アノテーション (gff / gff3)

Rs_1.0.Gene.LFY.gff.gz

Hayai Annotation ZEN

Raphanus_sativus_t3726.G002_zen_v1.0.gz

タンパク (pep / aa)

Rs_1.0.peptide.fa.gz

トランスクリプト (cDNA / mRNA)

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