Plant GARDEN
Raphanus sativus

Genome Assembly ID:t3726.G001

配列名:RSA_r1.0

ゲノム配列の詳細

学名 Raphanus sativus
配列名 RSA_r1.0
系統名 Aokubi S-h
アセンブリレベル Scaffold
配列数 76,592
染色体数 2n=18
配列長 (bp) 402,330,269
N50長 (bp) 46,262
シーケンシングの方法 Sanger, Illumina, PacBio
シーケンシングの方法のコメント NA
取得した配列量 246.5x
アセンブリ方法 SOAPdenovo2 r223
推定ゲノムサイズ (Mb) 538
登録者 Kazusa DNA Research Institute
論文 (DOIコード) 10.1093/dnares/dsu014
コメント NA

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染色体 /
Scaffolds
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配列の種類 ファイル名 データダウンロード コメント

遺伝子 (cds / gene)

RSA_r1.0_cds.gz

ゲノム

RSA_r1.0.gz

アノテーション (gff / gff3)

RSA_r1.0_genes.gff3.gz

Hayai Annotation ZEN

hayai_annotation_zen_PlantGARDEN_Kegg.tsv.gz

タンパク (pep / aa)

RSA_r1.0_pep.gz

トランスクリプト (cDNA / mRNA)

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