配列名:Lj3.0
ゲノム配列名 | Lj3.0 | 系統名 | Miyakojima MG-20 |
配列数 | 9 | 染色体数 | 2n = 2x = 12 |
配列長 (bp) | 447,416,816 | N50長 (bp) | 62,285,374 |
遺伝子の数 | 48,105 | 遺伝子数由来ファイル | Lj3.0_pep.fna |
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 | 48,105 | Hayai-Annotation バージョン | zen_v2.0 |
シーケンシングの方法 | Sanger, Illumina, 454 | 取得した配列量 | 35x |
アセンブリ方法 | Paracel Genome Assembler | 推定ゲノムサイズ (Mb) | 465 |
シーケンシングの方法のコメント | NA | コメント | NA |
論文クレジット情報 | 準備中 | データ/DB クレジット情報 | 準備中 |
責任著者 | Satoshi TABATA (Kazusa DNA Research Institute) | データソース名 | miyakogusa.jp 3.0 |
論文 (DOIコード) | 10.1093/dnares/dsn008 | データソースURL | http://www.kazusa.or.jp/lotus/ |
BUSCO バージョン | 5.1.0 | BUSCO データセット | embryophyta_odb10 |
BUSCO ゲノム | C:93.5%[S:86.9%,D:6.6%],F:3.7%,M:2.8%,n:1614 | BUSCO 遺伝子 (pep/cds) | C:79.8%[S:59.5%,D:20.3%],F:11.9%,M:8.3%,n:1614 |