Plant GARDEN
Lotus japonicus

Genome Assembly ID:t34305.G002

配列名:Lj3.0

ゲノム配列の詳細

学名 Lotus japonicus
配列名 Lj3.0
系統名 MG-20
アセンブリレベル Chromosome
配列数 9
染色体数 2n=12
配列長 (bp) 447,416,816
N50長 (bp) 62,285,374
シーケンシングの方法 "Sanger, Illumina, 454"
シーケンシングの方法のコメント NA
取得した配列量 35x
アセンブリ方法 Paracel Genome Assembler
推定ゲノムサイズ (Mb) 465
登録者 Kazusa DNA Research Institute
論文 (DOIコード) NA
コメント NA

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染色体 /
Scaffolds
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終了位置
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その他の配列

配列の種類 ファイル名 ダウンロード コメント

遺伝子 (cds / gene)

Lj3.0_cds.ffn.gz

ゲノム

Lj3.0_pseudomol.fna.gz

アノテーション (gff / gff3)

Lj3.0_gene_models2.gff3.gz

Hayai Annotation ZEN

hayai_annotation_zen_PlantGARDEN_Kegg.tsv.gz

タンパク (pep / aa)

Lj3.0_pep.fna.gz

トランスクリプト (cDNA / mRNA)

Lj3.0_cDNA.ffn.gz

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