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アセンブル , シーケンス , Assemble , Sequence , Lotus japonicus , Japanese trefoil , ミヤコグサ

Lotus japonicus

Genome Assembly ID:t34305.G001

配列名:Lj2.5

ゲノム配列の詳細

ゲノム配列名 Lj2.5 系統名 Miyakojima MG-20
配列数 7 染色体数 2n = 2x = 12
配列長 (bp) 301,341,829 N50長 (bp) 44,510,304
遺伝子の数 38,482 遺伝子数由来ファイル Lj2.5_cds.ffn
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 37,971 Hayai-Annotation バージョン zen_v2.0
シーケンシングの方法 clone-by-clone, shotgun 取得した配列量 NA
アセンブリ方法 PGA v. 2.6.2 推定ゲノムサイズ (Mb) 472
シーケンシングの方法のコメント NA コメント NA
論文クレジット情報 準備中 データ/DB クレジット情報 準備中
責任著者 Satoshi TABATA (Kazusa DNA Research Institute) データソース名 miyakogusa.jp 3.0
論文 (DOIコード) 10.1093/dnares/dsn008 データソースURL http://www.kazusa.or.jp/lotus/
BUSCO バージョン 5.1.0 BUSCO データセット embryophyta_odb10
BUSCO ゲノム C:54.6%[S:52.7%,D:1.9%],F:5.5%,M:39.9%,n:1614 BUSCO 遺伝子 (pep/cds) C:50.5%[S:48.3%,D:2.2%],F:18.2%,M:31.3%,n:1614

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染色体 /
Scaffolds
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fasta
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