配列名:Lj2.5
ゲノム配列名 | Lj2.5 | 系統名 | Miyakojima MG-20 |
配列数 | 7 | 染色体数 | 2n = 2x = 12 |
配列長 (bp) | 301,341,829 | N50長 (bp) | 44,510,304 |
遺伝子の数 | 38,482 | 遺伝子数由来ファイル | Lj2.5_cds.ffn |
Hayai-annotationにより注釈づけされた遺伝子数 | 37,971 | Hayai-Annotation バージョン | zen_v2.0 |
シーケンシングの方法 | clone-by-clone, shotgun | 取得した配列量 | NA |
アセンブリ方法 | PGA v. 2.6.2 | 推定ゲノムサイズ (Mb) | 472 |
シーケンシングの方法のコメント | NA | コメント | NA |
論文クレジット情報 | 準備中 | データ/DB クレジット情報 | 準備中 |
責任著者 | Satoshi TABATA (Kazusa DNA Research Institute) | データソース名 | miyakogusa.jp 3.0 |
論文 (DOIコード) | 10.1093/dnares/dsn008 | データソースURL | http://www.kazusa.or.jp/lotus/ |
BUSCO バージョン | 5.1.0 | BUSCO データセット | embryophyta_odb10 |
BUSCO ゲノム | C:54.6%[S:52.7%,D:1.9%],F:5.5%,M:39.9%,n:1614 | BUSCO 遺伝子 (pep/cds) | C:50.5%[S:48.3%,D:2.2%],F:18.2%,M:31.3%,n:1614 |