Plant GARDEN
Lotus japonicus

Genome Assembly ID:t34305.G001

配列名:Lj2.5

ゲノム配列の詳細

学名 Lotus japonicus
配列名 Lj2.5
系統名 MG-20
アセンブリレベル Chromosome
配列数 7
染色体数 2n=12
配列長 (bp) 301,341,829
N50長 (bp) 44,510,304
シーケンシングの方法 clone-by-clone, shotgun
シーケンシングの方法のコメント NA
取得した配列量 NA
アセンブリ方法 PGA v. 2.6.2
推定ゲノムサイズ (Mb) 465
登録者 Kazusa DNA Research Institute
論文 (DOIコード) 10.1093/dnares/dsn008
コメント NA

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染色体 /
Scaffolds
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配列の種類 ファイル名 データダウンロード コメント

遺伝子 (cds / gene)

Lj2.5_cds.ffn.gz

ゲノム

Lj2.5_pseudomol.fna.gz

アノテーション (gff / gff3)

Lj2.5_gene_models.gff3.gz

Hayai Annotation ZEN

hayai_annotation_zen_PlantGARDEN_Kegg.tsv.gz

タンパク (pep / aa)

Lj2.5_proteins.faa.gz

トランスクリプト (cDNA / mRNA)

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